利用 Cas9 - 腺嘌呤脱氨酶融合蛋白在细菌中实现可编程的腺嘌呤脱氨基编辑
精准的遗传操作对细菌生理学研究至关重要，但部分细菌因内源同源重组（HR）能力弱、缺乏兼容的外源 HR 系统，难以实现精准基因组编辑。本研究报道了一种利用 Cas9 切口酶与腺嘌呤脱氨酶融合蛋白，在细菌基因组中直接实现腺嘌呤（A）到鸟嘌呤（G）精准转换的快速高效编辑方法。
转录组分析揭示无色素粘质沙雷氏菌突变株的竞争性生长优势
粘质沙雷氏菌因产生红色次生代谢产物灵菌红素而备受关注，自然与实验室条件下均存在无色素突变株，但其丢失产色素能力的机制尚不明确。本研究发现，野生型粘质沙雷氏菌连续传代后，自发无色素突变株在数代内出现并快速取代野生型菌株，具备显著生长优势；且突变株中灵菌红素合成基因簇（pigA-N）完整无缺失，仅在转录水平显著下调。
植物种子提取油脂对解脂耶氏酵母生长及脂解活性的影响
解脂耶氏酵母是一种具有强大脂解能力的非传统酵母，广泛应用于工业脂肪酶、微生物油脂的发酵生产，而疏水底物是调控其生长与脂酶合成的核心因素。本研究系统评估了索氏提取法、Folch 提取法制备的杏仁油、榛子油、芫荽籽油，对解脂耶氏酵母 W29 菌株生长动力学、生物量积累及胞外脂解活性的影响。
胁迫诱导的交叉保护及复合胁迫响应在耐极端黑酵母中的研究
极端耐逆真菌栖息于多重胁迫叠加的环境，但现有研究多仅单一探究胁迫因子。本研究验证盐胁迫、低温胁迫或二者复合预处理，是否能提升黑酵母干燥与冷冻后的存活率；同时明确盐度与温度对生长的联合效应为加性还是协同性。
细菌血红蛋白 VHb 异源过表达提升解脂亚罗酵母赤藓糖醇生物合成
解脂亚罗酵母（Yarrowia lipolytica）是极具工业潜力的非常规酵母，但其发酵需氧量极高，成为大规模生产的瓶颈。本研究将密码子优化的透明颤菌血红蛋白基因（VHb）在解脂亚罗酵母中过表达，旨在实现低氧条件下以甘油为底物高效生长并合成赤藓糖醇。
通过培养基碳氮比和化学分子伴侣缓解高产脂解脂亚罗酵母中共表达分泌型真菌纤维素酶的代谢负担
解脂亚罗酵母（Yarrowia lipolytica）是优异的高产脂工业酵母，但自身缺乏纤维素降解酶系，无法直接利用木质纤维素原料。本研究在高产脂工程菌株 HA1 中，共表达 3 种核心真菌纤维素酶（嵌合型纤维二糖水解酶 CBH I、里氏木霉纤维二糖水解酶 CBH II、内切葡聚糖酶 EG II），系统评估异源纤维素酶共表达带来的代谢负担。
辅因子工程调控酿酒酵母发酵饮料中酯类与高级醇的研究进展
辅因子是酶促反应中电子、原子或官能团的核心载体，调控细胞氧化还原平衡与能量代谢；酿酒酵母胞内NAD (H)、NADP (H)、CoA、乙酰 - CoA等辅因子的丰度与比例，直接决定酯类、高级醇等关键香气物质的生物合成通量。
自然堆肥与蚯蚓堆肥过程中有机碳迁移及生物活性特征的定性评估与关联分析——不同猪粪/秸秆颗粒配比
猪粪 / 秸秆颗粒不同配比下，自然堆肥（NC）与蚯蚓堆肥（VC）中有机碳组分转化途径及其与微生物活性的关联机制尚不明确。本研究设置 5 种猪粪（PM）/ 秸秆颗粒（SP）配比（100:0、75:25、50:50、25:75、0:100）开展 60 天堆肥试验，结果表明 **T2（75:25）** 因初始 C/N 比（31.65±0.99）适宜，堆肥效能最优；
439株乳球菌基因组尺度代谢模型的高通量构建与比较揭示菌株特异性代谢多样性（食品发酵/发酵工程）
乳球菌是乳制品发酵、食品工业中的核心工业微生物，不同菌株在发酵性能、风味合成、胁迫耐受性等表型上存在显著差异，传统单菌株基因组尺度代谢模型（GSMM）无法覆盖物种全维度的代谢多样性，且存在构建效率低、标准化程度差的瓶颈。
鲍曼不动杆菌（一种医院获得性致病菌）多表位疫苗的构建与评价研究
背景与目的：多重耐药（MDR）鲍曼不动杆菌（Ab）已成为导致医院获得性感染的重要致病菌，常见临床表现包括呼吸机相关性肺炎和导管相关血流 / 尿路感染。鉴于鲍曼不动杆菌广泛的多重耐药表型，预防性疫苗策略对于保护易感人群至关重要。
新型柯萨奇病毒 B2 型灭活疫苗的生物学特性、免疫原性及小鼠体内保护效果研究
筛选并鉴定一株适合制备 CVB2 灭活疫苗的候选毒株，要求具有高滴度、良好遗传稳定性和免疫原性；系统评估候选毒株的生物学特性，包括基因型、毒力、复制能力和组织嗜性；制备基于该毒株的灭活疫苗并在小鼠模型中验证其免疫原性和保护效力；评估母源抗体对新生小鼠的被动保护效果，为 CVB2 疫苗的临床前研究提供实验依据。
通过删除果糖 - 二磷酸醛缩酶（Fba）和转醛醇酶（Tal）阻断赤藓糖醇代谢：一种优化布鲁氏菌 Re
本研究旨在通过阻断布鲁氏菌 Rev1 疫苗株的赤藓糖醇代谢通路，提高其安全性同时保持免疫原性。赤藓糖醇是布鲁氏菌在宿主生殖组织中优先利用的碳源，与疫苗株在怀孕动物中引起流产的副作用相关。研究构建了 fba 和 tal 单基因缺失株（Rev1Δfba、Rev1Δtal）及双基因缺失株（Rev1ΔfbaΔtal），利用芬兰 Bioscreen C 分析仪系统测定了这些突变株在含不同碳源（赤藓糖醇、葡萄糖、甘油）培养基中的生长曲线，并通过小鼠模型评估其毒力、免疫原性和保护效力。
三种佐剂对美人鱼发光杆菌美人鱼亚种灭活疫苗免疫效果的研究
近年来，美人鱼发光杆菌美人鱼亚种（Photobacterium damselae subsp. damselae）对水生动物的侵染日益增多，而依赖抗生素治疗易导致耐药性和食品安全问题。灭活疫苗与佐剂联用可显著增强免疫效果。该研究旨在评估三种佐剂（黄芪多糖、弗氏完全佐剂、4% 氢氧化铝凝胶）对美人鱼发光杆菌灭活疫苗免疫效果的增强作用。
平板计数法与吸光度法预测微生物生长的初级模型比较（疫苗生产质控应用）
预测微生物学中，描述微生物生长的初级模型选择常具有主观性。本研究旨在通过吸光度法（OD）与平板计数法（CFU）两种检测手段，系统评估三阶段线性、Gompertz、Logistic、Baranyi四种常用初级生长模型的预测性能。选取蜡样芽孢杆菌、单核细胞增生李斯特菌、大肠杆菌三种疫苗生产常见质控菌株，设置10²、10⁴、10⁶ CFU/mL三种初始浓度，在标准培养条件下获取生长曲线数据。
面向牛群、简易且低成本的肠出血性大肠杆菌（EHEC）概念验证型疫苗候选株的开发
肠出血性大肠杆菌（EHEC）是一种人兽共患病原菌，可引发人类严重疾病，包括出血性腹泻和溶血性尿毒综合征（HUS），主要由志贺毒素（Stx）介导。其肠道定植依赖 III 型分泌系统（T3SS），诱导细菌黏附与擦拭（A/E）损伤。牛是 EHEC 的主要宿主，收获前疫苗是减少人类暴露的关键。本研究构建了嵌合抗原 EIT（EspA₃₆₋₁₉₂-Intimin₆₅₃₋₉₃₅-Tir₂₅₈₋₃₆₁），使其在大肠杆菌 BL21 周质中表达，可通过热休克法简易提取。
不同流动条件下肠炎沙门氏菌动态生物膜的形成及纳米胶囊化百里酚的清除效果研究（疫苗载体 / 佐剂相关）
本研究聚焦动态流体环境下肠炎沙门氏菌（Salmonella Enteritidis）生物膜的形成规律，并评估纳米胶囊化百里酚（THY）对其的清除效能。首先在 0.006、0.045、0.087 cm s⁻¹ 三种流速下动态培养生物膜，结果显示生物膜菌量随流速升高而显著增加，最高流速下达 6.80 log CFU cm⁻²。随后制备两种纳米胶囊：麦芽糊精单层（ML）纳米胶囊与麦芽糊精 - 果胶层层自组装（LBL）纳米胶囊。
新型沙门氏菌疫苗候选株在家禽中的免疫原性及保护效力评估
背景：非伤寒型沙门氏菌（NTS）是主要的食源性致病菌，家禽产品（尤其是鸡蛋）是人类感染的主要来源。当前针对特定血清型的家禽疫苗虽能有效减少目标菌株，但可能促使鸡群内未靶向血清型的出现，因此亟需开发具有广谱交叉保护能力的新型疫苗。目的：评估新型亚单位疫苗候选株 InvG 的免疫原性，并通过母鸡卵黄传递的母源抗体，评估其减少接种母鸡及其子代沙门氏菌定植的能力。
猪圆环病毒 2d 型衣壳蛋白 - 壳寡糖（PCV2d Cap–COS）生物偶联候选疫苗的制备及免疫保
猪圆环病毒 2 型（PCV2）是当前威胁全球养猪业的主要病原体之一，其衣壳蛋白（Cap）是研发亚单位疫苗的关键抗原。本研究建立了一种基于巯基 - 马来酰亚胺点击化学反应的生物偶联策略，利用壳寡糖（COS）构建了共价连接的 PCV2d Cap–COS 复合物。
敏感与耐药大肠杆菌在生物膜状态下的生长动力学、抗生素敏感性及环丙沙星亚致死浓度的影响研究
本研究旨在探究敏感与耐药大肠杆菌在生物膜状态下的生长动力学特征、抗生素敏感性差异以及环丙沙星亚致死浓度对其的影响。研究采用 Bioscreen C Analyzer 测定了不同条件下大肠杆菌生物膜的生长曲线，比较了敏感株与耐药株在有无环丙沙星亚致死浓度处理下的生长速率、生物膜形成能力及抗生素耐受性差异。
临床分离屎肠球菌中核糖体蛋白 L3 缺失介导的利奈唑胺高水平耐药体内演化研究
本研究针对临床接受利奈唑胺治疗后出现耐药的屎肠球菌感染病例，收集治疗前后的配对临床菌株开展研究；经全基因组测序发现，耐药株核糖体大亚基蛋白 L3 的编码基因存在特异性片段缺失突变，该突变是介导利奈唑胺高水平耐药的核心分子机制；研究利用芬兰 Bioscreen C MBR 全自动微生物生长分析仪测定野生型菌株、L3 缺失突变株及基因回补株的生长曲线，定量分析各菌株的生长动力学特征与适应性代价；