基于丝状噬菌体的多功能工具包，用于拉尔斯顿伪日菌分子研究
青枯雷尔氏菌复合种（RSSC）是一种毁灭性的土传植物病原菌，迫切需要先进的遗传工具来解析其致病机制。本研究通过对丝状噬菌体RSCq进行基因组最小化和工程化改造，开发了一套多功能质粒系统pRSCq工具包。通过系统删除非必需基因并保留复制关键元件，构建了带有不同抗生素抗性标记且兼容Golden Gate克隆的稳定质粒pRSCq1-4。
关于贪铜菌Cupriavidus necator H16挥发性脂肪酸分解代谢遗传决定因素的见解
土壤细菌贪铜菌Cupriavidus necator H16是将废物衍生挥发性脂肪酸（VFAs）升级转化为可再生生物化学品的极具潜力的宿主。尽管细菌VFA代谢途径已被广泛研究，但C. necator基因组中每个分解代谢步骤都编码了多个同工酶，这些同源蛋白之间的底物特异性程度目前仍未知。为深入了解C. necator对VFA底物的分解代谢机制，本研究对以乙酸、丙酸、丁酸、戊酸或己酸为唯一碳源和能源生长的细胞进行了转录组学分析。
MexR和NalD是铜绿假单胞菌中外排泵MexAB-OprM的铜绿素响应型转录抑制因子
铜绿假单胞菌的次级代谢产物铜绿素（PYO）通过诱导耐药结节细胞分裂（RND）外排系统的表达显著增强其抗生素耐药性，但由多个转录抑制因子调控的MexAB-OprM的初始去阻遏和后续上调机制仍不清楚。本研究证明MexAB-OprM的转录抑制因子MexR和NalD可作为PYO受体，解离常数分别为5.17和7.03 μM。电泳迁移率变动分析显示，PYO与MexR和NalD结合会诱导它们从mexA启动子上解离，导致mexAB-oprM表达去阻遏。
新型氧化锰细菌木糖赖氨酸芽孢杆菌M125的分离：该菌株产生的生物源氧化锰的特性分析、结构演化及镉吸附
锰氧化细菌在将可溶性Mn(II)转化为不溶性Mn(III/IV)氧化物的过程中发挥着关键作用，其产物被广泛应用于环境修复尤其是重金属污染治理领域。本研究从电镀厂附近的锰污染土壤中，通过添加10 mmol/L氯化锰的选择性LB培养基富集分离，结合Leucoberbelin Blue（LBB）显色法筛选得到一株具有强锰氧化能力的菌株。
不同孔径域孔隙水中可溶性有机碳化学性质的差异
本研究探究土壤不同孔径大小孔隙中可溶性有机碳的化学组成差异及其微生物可分解性。通过负压法提取不同孔径孔隙水，利用超高分辨傅里叶变换离子回旋共振质谱表征有机碳分子组成，并接种典型土壤微生物进行培养实验。
代谢相互作用影响人工合成细菌生物膜群落的生物量
本研究结合共现网络分析、定量PCR、基因组尺度代谢模型与体外实验，探究根际来源的人工合成生物膜群落中物种间的相互作用。结果表明，群落生物量主要受关键物种调控，这些物种通过代谢促进或资源竞争发挥作用。阳性关键物种泛生泛菌（Pan）可作为代谢供体支持其他菌株生长，阴性关键物种根际金黄杆菌（Chr）则通过高强度资源竞争抑制整体生物量。
细菌对根细胞壁的修饰促进酸性土壤中水稻的铝抗性
植物根细胞壁是逆境土壤中作物胁迫抗性形成的关键微生物互作界面。根际微生物可通过养分交换和激素信号调控根系发育，但其在酸性土壤铝毒胁迫下对根细胞壁重塑的作用机制尚不明确。本研究证实，合成微生物群落（SynCom）可通过激活木葡聚糖内转糖苷酶（XET）活性，提升水稻根系的铝胁迫抗性。