利用套索肽实现多环芳烃生物降解
多环芳烃属于高毒难降解环境污染物，现有降解分子机制仍未完全阐明。本研究以可降解菲的鞘氨醇单胞菌BPH为研究对象，利用miniTn5转座子诱变得到3株菲降解缺陷突变株。其中1782株转座子插入联苯/萘双加氧酶大亚基基因bphA1，丧失菲降解能力；1778株插入套索肽合成簇的B2蛋白酶编码基因，首次证实套索肽参与多环芳烃降解过程。
利用医院不动杆菌假静息细胞强化聚乙烯降解的新型生物工艺
低密度聚乙烯（LDPE）化学性质稳定，传统微生物降解周期长达数月，降解效率偏低。本研究从塑料垃圾填埋场分离得到一株医院不动杆菌GNU001，提出假静息细胞全细胞催化新工艺提升LDPE降解效率。先在富LB培养基扩增菌体，离心洗涤转入无外源碳的基础培养基制备假静息细胞，5L发酵罐连续运行28天。
两株扑草净降解菌的分离鉴定与泛基因组比较分析
本研究从长期受扑草净污染的土壤中分离驯化得到两株能以扑草净为唯一碳氮源生长的降解菌T6-2与T7-2，经形态、生理生化与16S rRNA鉴定分别为枯草芽孢杆菌枯草亚种与缺陷短波单胞菌。优化培养条件后，T6-2在pH7、接种量5%时72h对75mg/L扑草净降解率达70.63%，T7-2在pH8、接种量10%时72h对50mg/L扑草净降解率达73.03%。种子安全性实验证实两株菌可有效缓解扑草净对玉米的毒害。
合成细菌联盟促进石油烃类降解：功能互补性与调控协调的见解
微生物修复技术广泛应用于石油污染土壤治理。虽然功能互补的菌株组合能够解决石油污染物生物利用度低和组成复杂的问题，但经验性混合菌群在波动的环境条件下往往缺乏功能稳定性。本研究系统评估了多种菌株组合，鉴定出一个优化的石油降解联盟CoA，由产生物表面活性剂的降解菌假单胞菌SB（Pseudomonas sp. SB）与两株烃类降解菌极端东方假单胞菌10-2（Pseudomonas extremorientalis 10–2）和耐盐不动杆菌PB（Acinetobacter halotolerans PB）组成。
对汉森德巴利酵母的转录组分析揭示了对苯并(a)芘暴露的解毒和应激反应
多环芳烃（PAHs）如苯并(a)芘（BaP）的环境积累因其持久性、致突变性和明确的致癌性，对生态系统和公共健康构成重大威胁。本研究调查了极端嗜盐酵母汉森德巴利酵母（*Debaryomyces hansenii*）在营养匮乏条件下激活特异性解毒机制降解BaP的能力。
通过工程化需钠弧菌对复杂有机污染物进行生物修复
工业废水、石油污染和塑料污染因其毒性、致突变性和持久性，已成为全球海洋生物安全的重大威胁。现有微生物生物修复技术受限于有机污染物的复杂性和菌株对高盐胁迫的耐受性不足。本研究利用合成生物学技术，将需钠弧菌（*Vibrio natriegens*）Vmax菌株改造为可在高盐废水和土壤中修复复杂有机污染物的工程菌株。
合成菌群强化石油烃降解：功能互补与调控协同机制研究
本研究针对石油污染土壤微生物修复中单一菌株代谢有限、复杂污染物降解效率低、环境适应性差等问题，采用自下而上策略构建高效石油烃降解合成菌群CoA，由产表面活性剂菌株与两种烃降解菌株组成。该菌群降解效果显著优于单一菌株，对pH、盐度、毒性中间产物具有强耐受性，通过代谢互补与FleQ介导的运动—生物膜动态调控实现高效降解。
模式古菌沃氏富盐菌氧化应激下的全局翻译响应研究：发现具有核糖体结合的非翻译小RNA
氧化应激会引发广泛细胞损伤，而嗜盐古菌具有高抗氧化抗性。本研究以沃氏富盐菌为模型，结合RNA-seq与核糖体图谱（Ribo-seq）解析氧化应激下的全局翻译景观。结果鉴定出281个翻译效率（TE）差异基因，下调基因富集于核糖体、翻译蛋白、过氧化物酶与TCA循环相关功能。
恶臭假单胞菌KT2440对糠醛与5-羟甲基糠醛的转化和同化作用
糠醛和5-羟甲基糠醛（HMF）是木质纤维素在高温热化学预处理、液化或热解过程中，己糖和戊糖脱水形成的典型产物，也是微生物转化过程中最主要的抑制剂。多数微生物仅能将这两种醛类还原为毒性更低的糠醇和羟甲基糠醇，形成无法被进一步利用的死端产物，同时消耗大量还原力。