分解代谢调控蛋白A对植物乳杆菌AR113体内定殖能力的影响
分解代谢调控蛋白CcpA是革兰氏阳性菌碳分解物阻遏效应核心调控因子，碳代谢直接影响益生菌肠道存活与定殖，但CcpA调控碳代谢如何影响植物乳杆菌体内定殖尚不明确。本研究利用CRISPR/Cas9构建植物乳杆菌AR113的ccpA敲除菌株AR113ΔccpA。体外生长实验显示敲除株最大OD生物量下降0.34，延滞期延长2.63 h，胆汁盐耐受显著变差；细胞粘附、自聚集、共聚集、菌体疏水性无显著变化。
拉莫三嗪回补RsgA缺陷型大肠杆菌的生长缺陷，揭示IF2在核糖体生物发生中的全新功能
RsgA是30S核糖体晚期组装GTP酶，功能是将RbfA从30S-RbfA复合物解离。大肠杆菌ΔrsgA敲除株生长迟缓，胞内17S rRNA（16S前体）与游离核糖体亚基大量累积。本研究发现多拷贝infB（编码IF2）过表达可回补ΔrsgA生长缺陷，同时共表达起始tRNA（i-tRNA）会产生协同增效作用，说明翻译起始复合物组装参与缺陷修复；IF2与i-tRNA共表达能促进17S rRNA加工成熟、保护16S rRNA 3'小结构域。抗癫痫药物拉莫三嗪（Ltg）可特异性结合IF，同样能改善ΔrsgA菌株生长，伴随17S加工提升、16S 3'端稳定、70S完整核糖体增多；但当rbfA携带L83R抑制突变（可自发释放RbfA）时，Ltg反而抑制菌株生长。
产酸克雷伯菌暴露于环丙沙星后的代谢响应：代谢组学研究
败血症相关致病菌快速鉴定与药敏检测是指导抗菌治疗、降低病死率的关键。本研究采用代谢组学手段，探究临床分离产酸克雷伯菌在不同浓度环丙沙星（二代喹诺酮类抗生素）胁迫下的代谢变化，挖掘耐药相关分子机制。实验联合傅里叶变换红外光谱（FT-IR）代谢指纹图谱与气相色谱-质谱（GC-MS）非靶向代谢轮廓分析：FT-IR可快速区分敏感株与耐药株；GC-MS在BHI培养液中共检出176种代谢特征物质，其中137达到MSI二级鉴定标准；40种代谢物在敏感/耐药菌株间存在显著差异，主要归属于中心碳代谢、精氨酸-脯氨酸代谢、丙氨酸-天冬氨酸-谷氨酸代谢、丙酮酸通路。
保守转录因子在代谢能力各异的嗜盐古菌中通过不同靶点调控糖异生过程
碳代谢通路的精准转录调控是微生物避免无效代谢循环、适应营养波动的核心机制。已知嗜盐古菌盐杆菌（Halobacterium salinarum）的TrmB转录因子调控糖异生，但该菌无法利用外源糖类，与多数可分解碳水化合物的嗜盐古菌代谢模式差异巨大。本研究选取可利用多种碳源、具备生物合成工业价值的西班牙盐盒菌（Haloarcula hispanica），系统表征其TrmB同源蛋白TrmB_Har，对比两种代谢分化古菌的TrmB调控网络差异。
担子菌近香侧耳新型次级代谢物及其对金黄色葡萄球菌生物膜的抑制活性研究
本研究从肯尼亚热带雨林分离的担子菌近香侧耳（Lentinus cf. sajor-caju）液体发酵提取物中分离鉴定3种全新微孔酸衍生物：微孔酸H、I、J（MAH、MAI、MAJ）。通过高分辨质谱、一维/二维核磁共振波谱完成全部化合物结构解析；结晶紫染色、XTT代谢活性检测、激光共聚焦显微成像等生物膜实验证实，微孔酸H与I具备金黄色葡萄球菌生物膜抑制活性，且发挥作用的药物浓度不会抑制浮游细菌正常生长；微孔酸I联用万古霉素、庆大霉素时可显著提升两种抗生素抗生物膜效果，微孔酸J无明显抑膜活性。该研究为真菌来源低毒抗生物膜先导化合物提供新资源，也为金黄色葡萄球菌生物膜相关感染联合给药方案提供新思路。
TbsP与TrmB共同调控gapII，影响古菌沃氏盐古菌的细胞发育表型
微生物需要持续调整生理状态以适应多变环境，高盐极端环境中的嗜盐古菌具备极强环境适应能力，模式古菌沃氏盐古菌可随营养、细胞密度改变细胞形态、生物膜形成与运动能力，但该生活方式转换的调控机制尚不明确。前期研究发现转录因子TrmB可在盐杆菌中激活糖异生通路基因，生成糖基用于细胞表面糖蛋白合成，维持菌体杆状形态。
对4698个单基因缺失菌株复制寿命的综合分析揭示保守的衰老机制
本研究以酿酒酵母为研究对象，对4698株单基因缺失存活菌株开展复制寿命全基因组筛选，最终鉴定出238株寿命延长菌株，其中189株为新发现菌株。这些长寿菌株的缺失基因分属多个功能集群，且酵母与秀丽隐杆线虫的长寿通路存在高度保守性。研究重点解析了tRNA转运相关基因LOS1，发现敲除LOS可显著延长酵母复制寿命。
化学与生物合成制备的三、四甲基取代新型双环内酯及其抗菌活性
本研究经五步化学合成得到10种异佛尔酮衍生物，包含两类带有三甲基、四甲基的不饱和双环内酯；选用多株真菌对上述内酯进行生物转化，得到4种全新羟基内酯，因四甲基不饱和内酯为非对映异构体混合物，开展结构解析；对全部不饱和内酯与羟基内酯进行抑菌试验与气味评定，结果显示部分化合物可抑制金黄色葡萄球菌、荧光假单胞菌、白色念珠菌、链格孢与青霉等致病微生物生长。
木糖压力下肺炎克雷伯氏菌的生长适应、抗菌敏感性、全局蛋白质组学分析及XylA和XylB蛋白的作用
本研究探究木糖对肺炎克雷伯氏菌浮游生长、毒力、抗菌敏感性及蛋白质组的影响。低浓度木糖（≤2%）促进三株肺炎克雷伯氏菌浮游生长，8%木糖则产生抑制作用。经8%木糖长期诱导的菌株K2044−8Xyl−60G表现出最佳生长适应，且未发生功能性氨基酸突变。
探索来自合欢的大豆苷元二甲醚作为抗铜绿假单胞菌的新型群体感应抑制剂：体外及体内研究的见解
多重耐药病原体包括铜绿假单胞菌的感染在免疫功能低下患者中导致高死亡率，凸显了对新型天然抗菌药物的迫切需求。本研究证明了果蔬中常见的植物化学物质具有抑制铜绿假单胞菌PAO1群体感应的能力。通过分子对接技术虚拟筛选了10种化合物，其中源自合欢的大豆苷元二甲醚对PA的生物膜形成以及弹性蛋白酶、绿脓素和鼠李糖脂等毒力因子的积累表现出最显著的抑制作用。
小链霉菌产生的细胞外色素的生物生产优化、表征及生物活性
放线菌尤其是链霉菌是生物活性代谢物的高产者，其产生的色素在食品、纺织、化妆品和制药领域有潜在应用。鉴于合成色素的安全性和环境影响问题日益突出，本研究旨在优化小链霉菌细胞外富色素组分的生产，并评估其在药妆领域相关的生物活性。研究采用Plackett-Burman设计筛选影响代谢物生产的关键变量，再通过Box-Behnken设计进行优化。
全局染色体拓扑结构与双组分系统协同调控链霉菌的转录
细菌基因表达受多层次调控，染色体超螺旋是最核心的全局调控因子之一。在具有复杂生命周期的链霉菌中，拓扑异构酶I（TopA）缺失会导致染色体超螺旋水平升高，改变大量基因的表达，造成生长延迟和孢子形成阻断。为了鉴定超螺旋诱导的孢子形成调控因子，本研究对TopA缺失的天蓝色链霉菌菌株进行随机转座子诱变，筛选能够在高超螺旋条件下恢复孢子形成的突变体。
一条由混杂性代谢酶构成的新型β-丙氨酸生物合成途径的鉴定
细菌通过高度特化酶组成的精密代谢系统适应环境中的营养物质，尽管这些酶可代谢其进化目标之外的分子，但其对混杂底物的催化效率通常被认为过低，不具备生理相关性。本研究探究了这些混杂酶代谢次级底物的效率，是否足以改变细胞表型。
野生型恶臭假单胞菌KT2440与基因组精简菌株EM42利用芳香族化合物和葡萄糖生产粘康酸的性能比较
恶臭假单胞菌KT2440是一株抗逆性强、芳香族化合物代谢能力优异的模式菌株，被广泛用于生物基和废弃基原料转化生产高附加值产物。为实现该菌株的工业化驯化，前人通过理性基因组精简构建了EM42菌株，该菌株被认为具备作为工业生产底盘的多项潜在优势。
ATP结合盒（ABC）转运系统溶质结合蛋白指导的根癌农杆菌C58中新型D-阿糖醇和半乳糖醇分解代谢途
针对基因组测序技术飞速发展带来的蛋白数据库中未知功能序列指数级增长、约50%自动注释存在错误或误导性的行业痛点，基于酶功能计划（EFI）开发的“转运体溶质结合蛋白（SBP）指导新型代谢途径发现”策略，首次将该策略从三聚体ATP非依赖性周质转运体（TRAP）拓展至ATP结合盒（ABC）转运体系。
饮用水处理厂生物滤池中分离的微生物菌群对氨甲基膦酸（AMPA）的生物降解作用
草甘膦的广泛使用使其在饮用水源中的检出率显著升高，其主要降解产物氨甲基膦酸（AMPA）难以通过传统水处理工艺去除，对公共健康和环境安全构成威胁。本研究探究了3种环境样品中分离的细菌对AMPA的生物降解能力，重点评估其在水处理系统中的应用潜力：3份样品分别来自英国某饮用水处理厂不同运行时长的颗粒活性炭（GAC）滤池，以及有草甘膦类除草剂施用历史的农田土壤。
低需盐嗜碱黑生盐单胞菌 X339 在非无菌开放条件下利用小麦秸秆水解物生产聚羟基丁酸酯
利用农业废弃物生产生物基产品是降低其生产成本的可持续途径。本研究报道了一株新型嗜盐嗜碱菌株 —— 黑生盐单胞菌（Halomonas nigrificans）X339，该菌株具备利用多种低成本碳源的优异能力。与其他嗜盐菌相比，X339 的最适生长盐度可低至 2%（w/v），且能在胞内积累超大尺寸的聚羟基丁酸酯（PHB）颗粒。