丁香假单胞菌番茄致病变种DC3000中五种Rsm蛋白的表达、调控及生理功能
RsmA/CsrA家族是一类在革兰氏阴性菌和部分革兰氏阳性菌中发挥关键转录后调控作用的小RNA结合蛋白。多数已研究的细菌仅含一个RsmA/CsrA基因，但丁香假单胞菌番茄致病变种（Pto）DC3000基因组编码五个Rsm蛋白：RsmA/CsrA2、RsmC/CsrA1、RsmD/CsrA4、RsmE/CsrA3和RsmH/CsrA5。
丁香酚靶向CrtM抑制金黄色葡萄球菌金黄色素的生物合成
金黄色葡萄球菌是严重威胁食品安全与公共健康的食源性致病菌，耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）的出现大幅提升了该菌感染的治疗难度。金黄色素是金黄色葡萄球菌的关键毒力因子，阻断其合成可助力宿主免疫系统清除入侵的金黄色葡萄球菌。
代谢与生物过程工程整合用于恶臭假单胞菌利用葡萄糖和木糖生产β-酮己二酸
β-酮己二酸是微生物有氧芳香族化合物分解代谢的常见中间体，可作为高性能生物基聚合物的单体。本研究对恶臭假单胞菌KT2440进行代谢工程改造，使其能够利用木质纤维素多糖水解产生的两种主要糖类——葡萄糖和木糖生产β-酮己二酸。以最优菌株GR038为研究对象，采用模拟木质纤维素水解液的2:1摩尔比葡萄糖-木糖混合底物开展生物过程开发，补料分批发酵实现了65.8 g/L的产物滴度、0.69 g/(L·h)的生产速率和0.52 C-mol的碳收率。
不同氮源对酿酒酵母生长与发酵性能的影响及其提升乙醇产量的作用评估
低酿酒价值葡萄品种的葡萄汁用于生物乙醇生产，是葡萄种植业多元化发展与产品增值的重要途径；超高重力（VHG）发酵技术可显著提升乙醇生产效率，同时降低生产过程中的水耗与能耗。本研究探究了不同氮源对本地筛选酵母菌株生长与发酵性能的影响，对3株酿酒酵母本地菌株、1株商业酿酒酵母菌株、1株鲁氏接合酵母菌株，在合成培养基与天然葡萄汁体系中，分别添加不同浓度的磷酸氢二铵（NH）、酵母提取物（YE）、商业发酵助剂Fermaid K（FERM）与尿素（U）进行发酵培养。
比较基因组分析揭示短杆菌属的潜在致病性和慢生长特性及皮山短杆菌新种的描述
短杆菌属是广泛分布于自然环境的革兰氏阴性菌，可引起人类医院获得性感染，但其基因组特征和致病性机制研究仍十分匮乏。本研究对24株短杆菌属模式菌株进行了系统的全基因组比较分析，发现该属细菌具有相对较小的基因组（平均3.13±0.29 Mb）但极高的GC含量（平均67.01±2.19 mol%），二维层次聚类将其划分为5个主要进化分支。
暴露于人类相关化学混合物的斑马鱼胚胎中细胞凋亡增加、Wnt/β-连环蛋白信号传导减弱及尾部发育改变
人类和野生动物体内已检测到多种人为产生的化学物质，但其暴露带来的健康影响尚不明确。生命早期阶段对化学干扰最为敏感，发育阶段的暴露可能导致成年后患病，但相关作用机制的研究仍不充分。本研究依托欧盟EDC-MixRisk项目，基于瑞典SELMA妊娠队列数据，确定了与新生儿出生体重呈负相关的化学混合物G，其由5种邻苯二甲酸单酯、三氯生及3种全氟烷基酸组成。
氨基酸对化学成分确定培养基中嗜热链球菌937游离胞外多糖生物合成的影响
嗜热链球菌产生的游离胞外多糖（f-EPS）可改善发酵乳制品的质构与功能特性，团队前期研究发现，将化学成分确定培养基（CDM）中组氨酸（His）、异亮氨酸（Ile）、谷氨酸（Glu）的浓度提升至15 mM时，嗜热链球菌937的f-EPS产量实现大幅提升。
β-内酰胺类抗生素耐药基因表达对大肠杆菌O157:H7辐射抗性特征的影响
部分病原体在应对特定胁迫处理时会产生有利的全局适应性，进而导致毒力增强和/或对其他胁迫的抗性提升。本研究围绕β-内酰胺耐药性，以及参与该耐药过程的ampC、ampG基因展开，评估其在大肠杆菌O157:H7辐射抗性中的潜在作用。研究构建了分别适配25、15、7 mg/mL卡那霉素或羧苄西林的大肠杆菌菌株，对其进行0.4 kGy致敏剂量或1.5 kGy致死剂量的辐照处理。
最小基因组中的代谢物损伤与损伤控制
通过分析最小化支原体JCVI-Syn3A基因组保留的基因，本研究证实代谢物损伤修复与预防系统是生命的基本必需组成部分。研究鉴定并实验验证了多个具有损伤控制功能的基因，包括5-甲酰四氢叶酸环化酶、辅酶A（CoA）二硫键还原酶及多种水解酶。
CpxR调控的yoaE基因在肠炎沙门氏菌于抗菌蛋清中存活的作用
肠炎沙门氏菌在抗菌蛋清中的存活能力是导致鸡蛋及蛋制品相关沙门氏菌爆发的重要原因。本研究探究了编码内膜蛋白的yoaE基因在肠炎沙门氏菌蛋清存活中的作用及其转录调控机制。定量RT-PCR结果显示，与M9FeS培养基相比，细菌在蛋清中暴露4h后yoaE基因表达上调35倍；敲除yoaE后，突变体在37℃和20℃下的蛋清存活率降至野生型和互补株的1%以下，表明yoaE是细菌在蛋清中存活的必需基因。
与环境定植相关的医院内克隆传播中分离的产 OXA-232 碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌的流行病学特征
本研究在某医院ICU开展产OXA-232碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌（OXA-232-CRKP）定植与感染监测，2019年8-12月共采集8656份样本，分离出106株OXA-232-CRKP，总阳性率1.22%，患者定植阳性率3.59%，环境阳性率0.66%。15例定植患者中6例发生相关感染，3例死亡。
金黄色葡萄球菌的进化历史影响抗生素耐药性进化
本研究探究万古霉素中介耐药金黄色葡萄球菌（VISA）在无抗生素压力下的耐药稳定性与进化规律。结果显示，VISA菌株在无万古霉素条件下会通过获得第二位点补偿突变恢复为敏感菌株（VSSA），但原始耐药突变得以保留。回复株再次接触万古霉素时，能更快重新进化出耐药性并达到更高耐药水平。
制霉菌素作用下酵母的进化拯救极限取决于倍性
本研究以酿酒酵母为模型，探究倍性对极端环境下进化拯救的影响。在高浓度制霉菌素胁迫下，单倍体酵母可通过麦角固醇合成通路的隐性突变快速产生抗性并实现进化拯救，而二倍体酵母在相同条件下无法进化出稳定抗性。即便扩大种群规模，二倍体仍未出现可遗传的抗性进化。
营养可利用性与噬菌体暴露改变铜绿假单胞菌群体感应及CRISPR-Cas调控的种群动态
本研究以铜绿假单胞菌为对象，探究营养条件与噬菌体暴露如何影响群体感应（QS）缺陷突变株（ΔlasRrhlR）与CRISPR-Cas缺陷突变株（ΔCRISPR）的抗性、相对适合度及种群动态。结果显示，营养限制条件下QS信号盲突变株具有适合度优势；QS诱导条件下，QS突变株比CRISPR-Cas突变株更不易被噬菌体选择；两种突变株混合可降低噬菌体感染力，提升种群存活率。营养与噬菌体共同重塑QS与CRISPR-Cas突变株的竞争格局，影响菌株间合作与冲突关系。
胰腺肿瘤细菌的存活机制及其代谢化疗药物的能力
本研究从胰腺癌前驱病变IPMN（导管内乳头状黏液瘤）中分离细菌菌株，探究其在肿瘤微环境中的存活机制及对5-氟尿嘧啶（5-FU）和吉西他滨两种化疗药物的代谢作用。结果显示，多数菌株可降低化疗药物对胰腺癌细胞的杀伤效果；全基因组测序表明，γ-变形菌富集抗生素耐药、药物转运与毒力相关基因，且嘧啶代谢通路显著上调，芽孢杆菌则富集嘌呤代谢通路。研究证实肿瘤相关细菌可通过适应肿瘤微环境代谢化疗药物，进而影响治疗效果。
西那卡塞对多重耐药革兰氏阳性病原菌具有快速杀菌与高效抗生物膜活性
本研究发现已上市药物西那卡塞对多重耐药革兰氏阳性菌具有良好抑菌活性，MIC范围3.13–25 μg/mL。该药物对金黄色葡萄球菌、粪肠球菌的浮游菌与持留菌具有快速强效杀菌作用，优于万古霉素、氨苄西林等临床抗生素，同时可显著抑制并清除耐甲氧西林金黄色葡萄球菌、利奈唑胺耐药粪肠球菌的成熟生物膜。
解析SMU.1147在变形链球菌肽介导信号传导与感受态中的作用
本研究以变形链球菌为对象，通过转录组分析探究核心基因SMU.1147的功能。缺失该基因会导致碳水化合物摄取与代谢相关基因上调，增强糖转运能力，但生长速率、ATP产量无显著变化，有机酸产量略有下降；同时，突变株细胞活力显著降低，CSP依赖的信号转导、应激防御相关基因（comX、comR、htrA、ciaRH等）及应激相关基因（spxA2、clpP、clpX）显著下调。
粪肠球菌中CroS/R双组分系统上调SEDS糖基转移酶以增强细胞壁应激时的肽聚糖合成
本研究针对粪肠球菌中除FtsW、RodA外的两种额外SEDS蛋白（FtsW2、RodA2）开展功能解析。证实二者均具有糖基转移酶活性，分别与PbpB、PbpA特异性结合；在FtsW缺失引发细胞壁应激时，CroS/R双组分系统上调ftsW2与rodA2表达，增强肽聚糖合成并提升头孢菌素耐药性；FtsW2可替代FtsW功能，RodA2可替代RodA功能，但二者不可互换。结果揭示额外SEDS蛋白是粪肠球菌应对细胞壁损伤、维持耐药性的重要补偿机制。
非洲流行非伤寒鼠伤寒沙门氏菌ST313菌株D23580多细胞行为的丢失
本研究针对非洲流行的非伤寒沙门氏菌ST313谱系菌株D23580展开探究，发现该菌株发生了两处功能丧失突变，分别导致稳态期过氧化氢酶KatE失活与纤维素合成酶BcsG提前终止，使其丧失氧化应激抗性与RDAR多细胞群落表型，削弱了在宿主外环境的生存能力。
变形链球菌中的MecA是一种多功能蛋白
本研究通过体外混合物种生物膜模型、蛋白质组学、亲和下拉与细菌双杂交实验，解析变形链球菌MecA蛋白的调控功能。缺失mecA显著降低葡聚糖生成，削弱混合物种生物膜形成能力，且表型与clpP、clpX、clpE等clp系列突变株均不完全一致。