功能性小RNA互作组解析万古霉素耐受金黄色葡萄球菌中万古霉素应答sRNA RsaOI的作用靶点
耐万古霉素金黄色葡萄球菌（VISA）会造成万古霉素临床治疗失败，小RNA（sRNA）调控细菌耐药，但绝大多数sRNA-mRNA互作的生物学功能尚不明确。本研究以VISA菌株JKD6008为研究对象，采用RNase III-CLASH捕获体内RNA互作网络，整合RNA-seq转录组、Ribo-seq核糖体图谱、LC-MS/MS蛋白质组多组学数据，借助自组织映射（SOM）机器学习算法对基因聚类，筛选出转录丰度高但蛋白表达偏低、存在翻译抑制的基因集群。
改变PBP4与GdpP功能协同介导金黄色葡萄球菌产生类MRSA高水平广谱β-内酰胺耐药
mecA/mecC基因编码PBP2a是金黄色葡萄球菌高水平广谱β-内酰胺耐药（MRSA）经典机制，但越来越多无mec基因的MRLM菌株同样表现耐甲氧西林表型，其耐药机制尚不明确。本研究结合基因敲除、回补、MIC测定、种群生长实验、Bioscreen全自动生长曲线检测、细胞壁组分分析、线虫体内感染模型开展验证。
负载组氨酸激酶抑制肽的第五代聚酰胺胺树状大分子对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的群体感应抑制活性
耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）是医院与社区高发多重耐药致病菌，群体感应agr系统调控毒素、生物膜等毒力因子，靶向群体感应是低耐药抗感染新思路。本研究以末端甲氧吡咯烷修饰第五代PAMAM（G5）树状大分子负载群体淬灭肽QQ3，制备G5-QQ3纳米复合物；采用Bioscreen C全自动微生物浊度仪测定浮游菌生长曲线与MIC50，结合溶血实验、结晶紫生物膜定量、共聚焦活死染色、扫描电镜、RAW264.7巨噬细胞毒性实验开展活性评价。
基于结构虚拟筛选与生物学验证发现可恢复耐碳青霉烯鲍曼不动杆菌碳青霉烯敏感性的新型BfmR抑制剂
耐碳青霉烯鲍曼不动杆菌（CRAB）临床耐药问题严峻，BfmR是调控细菌毒力、抗生素耐药的双组分响应调控蛋白，是新型抗感染理想靶点。本研究以BfmR蛋白晶体结构为基础，搭建分层虚拟筛选流程，结合分子对接、分子动力学、MM/GBSA结合自由能计算筛选Specs化合物库，得到3个活性先导分子Cmp-86、Cmp-97、Cmp-98。体外实验证实三者均可降低美罗培南对CRAB菌株ZJ06的MIC；其中Cmp-98作用与BfmR敲除株效果相近，可下调K荚膜合成基因。
利用非洲大蜗牛壳简易合成并表征壳聚糖纳米颗粒，作为抗微生物耐药的潜在方案
全球抗生素耐药危机日益严峻，亟需天然可降解抗菌新材料。本研究以废弃非洲大蜗牛壳为原料，经脱蛋白、脱矿、脱乙酰等多步化学处理制备壳聚糖纳米颗粒；采用FTIR、XRD、SEM、TEM、EDXRF、EDS完成理化结构表征，利用芬兰Bioscreen C全自动微生物浊度仪测定最小抑菌浓度，同时琼脂扩散法测定抑菌圈，以左氧氟沙星作为阳性对照，测试菌株包括β-溶血性金黄色葡萄球菌、表皮葡萄球菌、大肠杆菌O157、肺炎克雷伯菌、伤寒沙门氏菌。
Pbp4为FtsW-PbpB肽聚糖合酶提供转肽酶活性以驱动粪肠球菌头孢菌素耐药
粪肠球菌天然对头孢菌素类抗生素存在固有耐药，分裂区肽聚糖合酶FtsW-PbpB是维持菌体分裂的核心复合物，但PbpB极易被头孢菌素酰化失活，该复合物如何在药物胁迫下持续合成细胞壁尚不明确。本研究以粪肠球菌OG1RF为模式菌株，构建pbpB、ftsW、pbp4诱导耗尽突变株，利用芬兰Bioscreen C全自动浊度仪测定生长曲线与头孢曲松MIC，结合差异干涉显微镜、体外糖基转移酶GTase活性实验、蛋白共纯化、微量热泳动MST互作检测等开展机制解析。
基于原子分散纳米酶的协同温和光热-纳米催化疗法用于清除多重耐药菌并促进感染创面愈合
多重耐药菌（MRSA）感染创面临床缺乏高效无耐药治疗手段，单一光热或纳米催化疗法抗菌效果有限。本研究通过MOF高温热解法制备氮掺杂碳纳米片负载铜锰双原子纳米酶（Cu/Mn-DSAzymes），该材料兼具类过氧化氢酶（CAT）、类氧化酶（OXD）双酶活性与近红外二区（NIR-II）光热性能；搭配96孔全自动微生物生长分析仪（Bioscreen C）记录大肠杆菌、MRSA生长曲线，结合材料理化表征、体外抗菌、细胞相容性、小鼠感染创面体内实验开展系统验证。
KPC过表达介导碳青霉烯耐药临床肺炎克雷伯菌产生头孢他啶-阿维巴坦异质性耐药
头孢他啶-阿维巴坦（CZA）是治疗产KPC碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌（CRKP）的核心复方药物，但临床菌株会出现CZA异质性耐药，常规药敏检测易误判为敏感，造成抗感染治疗失败，相关分子机制尚不明确。本研究收集2020-2022年国内3家三甲医院311株临床CRKP，通过种群图谱PAP筛选CZA异质性耐药菌株，结合微量肉汤稀释药敏、MLST分型、荚膜血清分型、全基因组测序、qRT-PCR基因拷贝与表达定量、反义RNA基因沉默、生长曲线检测、不同联用药物抑制实验开展系统探究。
携带多重耐药基因的泛耐药铜绿假单胞菌IncP-2A型质粒pMAS152特征及研究意义
多重耐药菌水平基因转移加剧全球抗菌药物耐药危机，质粒是耐药基因横向传播关键载体，解析耐药质粒特征与传播风险对感染防控至关重要。本研究以一株临床泛耐药铜绿假单胞菌MAS152为研究对象，结合药敏实验、接合转移试验、长短读长全基因组测序及生物信息分析，系统解析其携带的IncP-2A型大质粒pMAS152。
CroS胞外片段不参与信号感知，但可微调CroS信号强度以调控粪肠球菌头孢菌素耐药
粪肠球菌是临床重要条件致病菌，天然对头孢菌素类抗生素固有耐药，双组分调控系统CroS/R是介导该固有耐药的核心通路。CroS作为组氨酸激酶，感知头孢诱导细胞壁应激后发生自磷酸化，激活响应调节蛋白CroR，上调细胞壁合成相关基因表达产生耐药。
AMXT-1501靶向膜磷脂发挥抗革兰氏阳性与阴性多重耐药菌活性
多重耐药细菌感染给全球医疗体系带来巨大威胁，碳青霉烯耐药肠杆菌科（CRE）几乎对全部现有抗生素耐药，临床治疗手段极度匮乏。本研究从化合物文库筛选得到多胺转运抑制剂AMXT-1501，系统评估其体内外广谱抗菌、抗生物膜活性，并解析作用靶点与分子机制。体外药敏结果显示AMXT-1501对MRSA、产ESBL大肠杆菌、碳青霉烯耐药克雷伯菌、铜绿假单胞菌均具备良好抑菌活性，MIC50/MIC90范围3.13–12.5 μM；杀菌动力学实验证实其杀菌速度优于万古霉素、替加环素；亚抑制浓度下可抑制金黄色葡萄球菌、粪肠球菌生物膜形成，但无法清除成熟生物膜。
KDPG感应蛋白RccR调控铜绿假单胞菌碳代谢与氨基糖苷类抗生素耐受性
铜绿假单胞菌依靠复杂转录调控网络快速重塑细胞代谢，以此适应宿主微环境、产生抗生素耐受，但转录调控、碳代谢与氨基糖苷耐受三者的关联机制尚不清晰。本研究利用CRISPR/Cas12k转座子构建铜绿假单胞菌转录因子突变文库，筛选发现RpiR家族转录因子RccR（PA5438）是调控氨基糖苷耐受的关键基因；敲除rccR可显著提升菌株对妥布霉素、庆大霉素、阿米卡星耐受能力，对其他类别抗生素无影响。
阪崎克罗诺杆菌暴露于亚致死乙醇后无法产生同源直接防护与交叉胁迫防护效应
乙醇是食品加工环节常用消毒试剂，生产中消毒剂稀释不当、设备干燥不充分会让阪崎克罗诺杆菌长期处在亚致死乙醇环境，细菌可能产生同源耐受或对其他胁迫产生交叉保护，带来食品安全隐患。本研究对菌株开展11代梯度亚致死乙醇连续驯化，采用芬兰Bioscreen C仪器测定24 h细菌OD生长曲线确定乙醇MIC；结合威布尔灭活模型、扫描电镜、Zeta电位、脂肪酸GC-MS、表面增强拉曼光谱多手段解析菌体生理变化。
靶向ftsZ的反义抗菌剂树突状多肽递送系统优化
多重耐药金黄色葡萄球菌临床感染缺乏新型治疗手段，反义寡核苷酸（ASOs）是潜力抗菌分子，但递送效率低、细胞毒性高限制应用。本研究以细菌生存必需基因ftsZ为靶点设计并筛选最优反义序列AS0515；对前期构建树突多肽纳米递送体系DP-AD进行优化，将N/P比值由8:1下调至6:1，对比携带8、10个正电荷的DPP8、DPP7两种载体。采用英国BioScreen全自动微生物生长仪监测菌株生长曲线，结合DLS、TEM、流式、CCK8、qPCR开展系列表征与活性验证。
载药近红外光热协同抗菌复合微针阵列用于抗耐甲氧西林金黄色葡萄球菌感染
临床耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）皮肤软组织感染常规全身给药存在病灶药物浓度低、破坏皮肤正常菌群、易诱导耐药等缺陷。本研究设计双层复合微针阵列，外层为可溶聚乙烯醇/聚乙烯吡咯烷酮基质负载万古霉素，内层水不溶性PMMA光热核心负载Au/SiO₂等离子纳米聚集体；对比PVA、PVP两种水溶性外层聚合物对微针形貌、载药量、光热性能的影响，筛选30 wt% PVA为最优外层材料。
异维A酸自纳米乳化给药系统：制备、优化及抗菌活性评价
异维A酸是治疗重度痤疮核心药物，但水溶性极差，口服存在肝脏首过效应，普通外用制剂透皮效率低，限制临床疗效。本研究选用蓖麻油为油相、Cremophor EL表面活性剂、Transcutol HP助表面活性剂构建SNEDDS自纳米乳化体系；通过溶解度、乳化试验筛选辅料，绘制伪三元相图确定自乳化稳定区间，制备4组不同配比处方并完成粒径、PDI、透光率、体外溶出、冷热/冻融/离心稳定性全理化表征；
新型小分子化合物YH7以sarX依赖模式抑制金黄色葡萄球菌生物膜形成
多重耐药金黄色葡萄球菌（MRSA）易形成生物膜，大幅提升抗生素耐药性，常规抗生素易诱导细菌耐药，抗毒力策略成为新型抗感染思路。本研究合成马来酰亚胺-二硒杂化小分子YH7，体外MIC测定显示该化合物对甲氧敏感金葡菌（MSSA）、多重耐药MRSA的MIC均为16 μg/mL；采用芬兰Bioscreen全自动微生物检测仪测定不同浓度YH7下细菌24 h生长曲线，4 μg亚抑菌浓度几乎不影响浮游菌增殖，但可显著抑制生物膜生成。
植物乳杆菌 Z057 新型细菌素的分离纯化、特性表征及其对副溶血性弧菌的抑菌与抗生物膜活性研究
副溶血性弧是常见食源性致病菌，易在食品接触面形成生物膜，常规化学消毒剂存在毒性、易诱导耐药等缺陷，乳酸菌细菌素是安全天然抑菌候选物质。本研究从植物乳杆菌Z057发酵上清液经乙酸乙酯萃取、Sephadex LH-20凝胶层析、反相高效液相三步纯化得到新型细菌素plantaricin Z057，液质联用确定其分子量1272.61 Da，氨基酸序列A-G-G-D-G-G-H-G-G-S-I-I-L-Y，数据库比对无同源序列，属于全新细菌素。
通过破坏NAD+/NADH稳态评价硫脲衍生物TD4对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的抗菌活性
本研究合成8种硫脲衍生物并筛选抗菌活性，化合物TD4抑菌效果最优。体外实验显示TD4对多种金黄色葡萄球菌（含MRSA、VISA）、耐甲氧西林表皮葡萄球菌、粪肠球菌均具备强效抑制作用，MIC为2–16 μg/mL，对革兰氏阴性菌无抑制效果。采用芬兰Bioscreen C设备测定细菌生长曲线，TD4呈浓度依赖性抑制MRSA增殖；时间杀菌实验显示4倍MIC浓度处理4 h可大幅降低活菌数量。电镜观测证实TD4会破坏MR细胞壁完整性、造成胞内容物外泄。
基于高通量筛选与强化学习设计用于鲍曼不动杆菌肺部感染的新型香豆素衍生物
多重耐药鲍曼不动杆菌是临床高致死院内致病菌，现有抗生素普遍出现严重耐药，亟需新型抗菌小分子。本研究合成两类香豆素衍生物（1–5）与二氢吡喃衍生物（6–10），通过微量肉汤稀释法结合芬兰Bioscreen C全自动微生物生长分析仪测定各化合物对多株临床多重耐药鲍曼不动杆菌生长抑制曲线，筛选得到最优活性分子S1032（化合物1）。