美国佐治亚州洋葱叶片中分离得到的新型植物病原菌——洋葱假单胞菌
本研究对从美国佐治亚州洋葱病叶中分离的三株细菌菌株进行多相分类学鉴定。该菌株在B氏B培养基上可产生扩散型荧光色素，菌落呈黄色。16S rRNA基因测序结果显示，菌株与浅绿假单胞菌相似度达99.6%，亲缘关系最近。全基因组系统发育分析表明，这三株菌株形成独立的单系分支；其与浅绿假单胞菌模式株的平均核苷酸一致性为91.6%，数字DNA杂交值低于45.8%。
番茄丁香假单胞菌DC3000中两种功能分化的3-磷酸甘油醛脱氢酶研究
3-磷酸甘油醛脱氢酶（GAPDH）是糖酵解关键管家酶，还具备兼职蛋白功能，但在植物病原丁香假单胞菌中的功能尚不清晰。本研究针对番茄致病变种DC3000基因组内3个gap同源基因（gap1、gap2、epd/gap3）开展功能解析。结果表明Gap1主要行使糖酵解脱氢功能，依赖NAD为辅酶；Gap2以NADP为辅酶，主导糖异生过程；Epd无典型GAPDH活性，专一催化赤藓糖-4-磷酸脱氢，参与维生素B6生物合成。
一种转移调控因子通过调控细胞色素bd氧化酶基因表达，助力水稻条斑病菌的氧化胁迫适应与毒力发挥
水平基因转移是细菌进化的重要驱动力。水稻条斑病菌BLS256中的xoc_2868基因为水平转移获得的转录因子，已有研究证实其参与氧化胁迫应答与致病性，但具体调控机制尚不明确。本研究通过进化分析发现，xoc_2868与其下游相邻基因大概率从伯克霍尔德氏菌祖先处共同转移而来。
PTSNtr-KdpDE-KdpFABC通路参与费氏中华根瘤的低钾胁迫适应与竞争结瘤
本研究围绕广谱宿主费氏中华根瘤CCBAU45436开展，解析PTSNtr-KdpDE-KdpFABC信号通路功能。该通路中未磷酸化PtsN蛋白经KdpD的GAF结构域结合激酶，KdpD通过HisKA-HATPase区段互作调控应答蛋白KdpE，KdpE直接激活高亲和钾转运操纵子kdpFABC。
新型抗菌剂苯并噻唑啉酮防治梨火疫病的效果评价
梨火疫病是由梨火疫欧文氏菌引起的毁灭性细菌性病害，长期使用抗生素导致抗性问题突出。本研究系统评价了我国自主创制的新型杀菌剂苯并噻唑啉酮对梨火疫病的防控潜力。结果显示，苯并噻唑啉酮对梨火疫病菌的EC₅₀为0.48–0.67 μg/mL，具有广谱抗细菌、抗真菌活性。
细菌传感器通过降低复杂度完成进化
细菌胞外配体结合结构域（LBD）以Cache结构域最为普遍，分为单模块sCache与双模块dCache。传统观点认为传感器进化以复杂度增加为主，而本研究提出相反机制。在植物病原菌黑胫欧文氏菌中鉴定到甲酸特异性趋化受体PacF，其配体结合结构域为双模块dCache（Cache_3–Cache_2），甲酸仅结合在远离膜的模块上。
西瓜嗜酸菌中功能性HipBA毒素-抗毒素系统的证据
细菌性果斑病（BFB）是由革兰氏阴性菌西瓜嗜酸菌引起的毁灭性种传病害，给全球葫芦科产业造成了重大经济损失，但该病原菌的致病分子机制仍不明确。毒素-抗毒素（TA）系统是细菌应对环境胁迫的关键调控元件，由编码稳定毒素蛋白和不稳定抗毒素蛋白的两个相邻基因组成。
唐菖蒲伯克霍尔德菌在洋葱叶片和鳞茎鳞片组织中的独特毒力机制
唐菖蒲伯克霍尔德菌洋葱致病变种（Bga）引起的洋葱滑皮病是全球洋葱产区常见的细菌性病害，但其毒力机制研究仍十分有限。本研究以Bga菌株20GA0385为对象，采用反向遗传学方法，以近缘水稻病原菌唐菖蒲伯克霍尔德菌为参考进行比较基因组学分析，鉴定候选毒力因子和调控因子。
来自不同荚膜组织胞浆菌菌株的细胞外囊泡调节吞噬细胞功能并促进真菌持续性感染
本研究探究了荚膜组织胞浆菌两种表型与基因型均不同的菌株（G-217B、G-184A）所释放的细胞外囊泡（EVs）对小鼠骨髓源巨噬细胞（BMDMs）和树突状细胞（BMDCs）的调控作用。两种宿主细胞均可内吞该真菌EVs，并引发不同的功能应答。
植物相关细菌中的一类化学感受器家族优先响应植物信号分子3-磷酸甘油
细菌对植物化合物的趋化作用是其定殖植物的初始步骤，植物病原菌和植物相关细菌含有的化学感受器数量约为普通细菌的两倍，表明趋化对细菌–植物互作至关重要，但相关感受器与效应分子信息仍然有限。本研究从黑胫病病原菌Pectobacterium atrosepticum中鉴定出化学感受器PacP，其sCache配体结合结构域可特异性识别磷酸化C3化合物并介导趋化吸引。
揭示一株新型噬菌体侵染园艺黄单胞菌莴苣致病变种的宿主互作与进化限制因素
本研究分离并鉴定了一株裂解性噬菌体ΦXhv-1，属于有尾噬菌体纲的一个新属。利用转座子插入测序（Tn-seq）鉴定出36个对噬菌体侵染必需的细菌基因，主要参与脂多糖（LPS）合成与表面多糖修饰。定点突变与荧光显微镜证实，ΦXhv-1吸附于LPS的O-抗原侧链特定残基。噬菌体抗性突变体在体外运动能力下降，且在植物体内毒力显著降低。
基于大蒜提取物的二硫化物衍生物合成及作为Ⅲ型分泌系统抑制剂抗梨火疫病菌的生物学评价
梨火疫病由梨火疫欧文氏菌（*Erwinia amylovora*）引起，严重威胁蔷薇科果树生产。Ⅲ型分泌系统（T3SS）是该菌关键致病因子，可向植物细胞分泌效应蛋白引发病害。本研究以大蒜提取物中的二硫键活性结构为母体，设计合成39个二硫化物小分子，利用*lux*发光报告系统高通量筛选T3SS抑制剂。
黄单胞苷芳基多烯的结构多样性及黄单胞菌植物病原合成所需基因的功能分析
黄单胞菌属是一类可侵染400余种植物的革兰氏阴性植物病原细菌，其标志性特征是产生黄色膜结合色素——黄单胞苷（xanthomonadin）。本研究对5个物种共24株黄单胞菌进行芳基多烯甲酯（MEAP）制备，经HPLC与Q-TOF–MS鉴定出3种主要MEAP：双溴甲基化MEAP-1、双溴非甲基化MEAP-2、单溴非甲基化MEAP-3，并据此将菌株分为3类。
大麦中两种主要植物毒性生物碱的微生物降解
大麦会产生大麦芽碱和芦竹碱两种植物毒性生物碱作为抵御病虫害的防御物质，这些生物碱会影响根际微生物群落结构，且在土壤中持久存在会带来潜在生态风险，但此前参与其降解的微生物和代谢途径尚未被阐明。本研究从大麦根际土壤中成功分离得到两株特异性降解菌：革兰氏阴性假单胞菌NyZ201（能以大麦芽碱为唯一碳、氮、能源生长，倍增时间2.5 h）和革兰氏阳性节杆菌NyZ202（能以芦竹碱为唯一碳、氮、能源生长，倍增时间3.8 h）。
贝莱泽芽孢杆菌YJ0-1胞外抑制产物的分离纯化及发酵培养基优化
大豆是全球重要的经济作物，核盘菌引起的大豆菌核病严重威胁其产量和品质，传统化学防治面临环境污染、病原菌抗药性等问题。本研究从中国东北落叶松根际土壤中分离得到的贝莱泽芽孢杆菌YJ0-1对核盘菌具有显著拮抗作用，其发酵液酸沉淀粗提物表现出强抗真菌活性。
Lrp/AsnC家族转录调控因子Lrp对于稻迪基氏菌的致病性至关重要
稻迪基氏菌可引起多种重要作物的严重软腐病，为解析其复杂的致病机制，本研究通过转座子诱变筛选关键毒力调控因子，在稻迪基氏菌EC1菌株中鉴定到一个Lrp/AsnC家族转录调控因子，命名为Lrp。表型分析表明，Lrp正调控生物膜形成以及泽胺类毒素（zeamines）、蛋白酶和多聚半乳糖醛酸酶的产生，负调控细菌游泳运动。缺失lrp基因导致细菌毒力显著衰减，证明Lrp是调控稻迪基氏菌致病性的关键因子。
系统发育宿主范围指数揭示噬菌体专化与毒力的生态限制
噬菌体通常被认为宿主范围有限，仅能感染特定细菌种内的菌株，但准确量化其特异性仍面临巨大挑战。传统宿主范围分析方法往往忽略宿主细菌的遗传多样性和种群动态，而这些因素可能深刻影响噬菌体的专化进化与毒力演化。本研究以遗传多样性极高的植物青枯病病原菌青枯雷尔氏菌复合种（RSSC）为模式系统，利用来自西南印度洋留尼汪岛和毛里求斯的23株遗传多样性噬菌体，开发了全新的宿主范围分析方法并验证了噬菌体生态学与进化的核心假说。
西方蜜蜂（膜翅目：蜜蜂科）乳酸菌在抗击类芽孢杆菌感染中的抑制和预防作用
随着蜜蜂细菌性疾病生物防治替代方法的需求日益增长，开发基于益生菌的蜜蜂生长、免疫功能和防御增强策略具有重要意义。蜜蜂拥有丰富的微生物组，其中乳酸菌是其核心组成部分。本研究从健康西方蜜蜂中分离鉴定了蜜蜂乳杆菌属（Apilactobacillus）、明串珠菌属（Leuconostoc）和肠球菌属（Enterococcus）菌株，评估了其作为美洲和欧洲幼虫腐臭病防控替代产品的潜力。
同时用氧化锌纳米颗粒和枯草芽孢杆菌处理种子对红甘蓝幼苗生物质量参数的影响
为减少农用化学品对环境的负面影响，实现可持续粮食生产，开发新型绿色农业策略迫在眉睫。氧化锌纳米颗粒（ZnONPs）和植物根际促生菌（PGPR）枯草芽孢杆菌被证实具有促进植物生长的潜力，但两者联合使用的效果及相互作用机制尚不明确。本研究首先评估了0.2-1.4 mgcm³浓度范围内ZnONPs对枯草芽孢杆菌浮游生长、吲哚-3-乙酸（IAA）产生、生物膜形成、伊文思蓝降解能力及氧化应激水平的影响，筛选出对细菌毒性最低的0.2和0.4 mgcm³两个浓度用于后续种子处理实验。
载番木瓜籽提取异硫氰酸苄酯的纳米结构脂质载体对白色念珠菌的体外及体内抗真菌功效增强
白色念珠菌是最常见的条件致病性真菌，在免疫低下人群中可引发致死性系统性念珠菌病。氟康唑等唑类药物的长期广泛使用导致耐药性显著上升，成为临床治疗的重大挑战。本课题组前期从番木瓜籽中提取得到高纯度异硫氰酸苄酯（BITC），发现其对白色念珠菌具有显著抑制活性，但BITC存在稳定性差、水溶性低、易挥发降解等缺陷，严重限制了其应用。