两株新分离的爱德华氏噬菌体对杀鱼爱德华氏菌感染的治疗效果
水产养殖中多重耐药细菌的传播带来严重威胁，噬菌体疗法因杀菌效果优异，成为替代抗生素的可行方案。本研究从污水中分离得到两株新型杀鱼爱德华氏噬菌体vB_EpM_ZHS和vB_EpP_ZHX，经形态与基因组鉴定，二者分别归属于肌尾噬菌体科和短尾噬菌体科。两种噬菌体复配使用后，体外抑菌和体内治疗效果均得到提升。
氧化还原类药物甲硝唑与耗硫大蒜化合物对涡旋旋核原虫具有协同作用
涡旋旋核原虫是一种原生动物寄生虫，会导致淡水神仙鱼大量死亡。由于法规限制，水产养殖中主流治疗药物甲硝唑的使用受到制约。大蒜提取物具备良好的抗菌抗寄生虫活性，本研究选取大蒜活性成分阿焦烯油开展相关试验。体外检测结果显示，阿焦烯油对涡旋旋核原虫的最低抑菌浓度为40 μg/ml，经气相色谱、核磁共振分析证实该提取物含有(E)型、(Z)型阿焦烯以及二烯丙基二硫醚、二烯丙基三硫醚等成分，其中仅(Z)型阿焦烯具备显著抑虫活性，最低抑菌浓度为16 μg/ml。
利用高通量筛选方法合成与评估从海洋宏基因组提取的水生抗菌肽
本研究针对水产养殖中细菌性疾病频发与抗生素耐药问题，采用机器学习模型从凡纳滨对虾养殖池塘宏基因组中预测抗菌肽，传统土塘每兆碱基抗菌肽含量高于生物絮塘与高位池。共预测1033条潜在抗菌肽，经结构与理化性质筛选得到10条候选肽，通过无细胞蛋白表达系统高通量筛选出9条具有抗菌活性的肽，最终化学合成3条（K-5、K-58、K-61）。
抗菌物质丹皮酚调控嗜水气单胞菌外排泵与膜通透性：蛋白质组学见解及在草鱼肉保鲜中的应用
丹皮酚是具有抗菌潜力的天然植物化合物，本研究发现其对嗜水气单胞菌的半抑制浓度IC50为256.8 μg/mL，可抑制12株细菌生长。丹皮酚通过降低细菌运动性、抑制生物膜形成、增强细胞膜通透性、降低外排泵活性发挥抗菌作用。蛋白质组学显示，丹皮酚处理后外排泵相关蛋白上调、ABC转运蛋白下调，与外排泵抑制剂CCCP联用可增强抗菌效果。
鱼型爱德华氏菌中ArgR依赖的细菌对宿主脂滴的抗性
脂滴作为天然免疫枢纽参与宿主抗菌防御，胞内病原菌需抵抗宿主脂滴才能完成定植与免疫逃逸。本研究以鱼型爱德华氏菌为对象，利用转座子插入测序筛选其抵抗大菱鲆宿主脂滴的关键基因，发现脂滴胁迫会导致细菌胞内精氨酸积累，精氨酸代谢核心调控因子ArgR通过调控精氨酸分解代谢、合成与转运相关基因表达维持胞内精氨酸稳态，帮助细菌抵抗脂滴杀伤。
共生菌与噬菌体捕食在抑制致病性副溶血性弧菌定植中的协同作用
定植抵抗是微生物组抑制病原菌入侵的核心机制，但其生态与分子决定因素尚未完全明确。本研究构建明确的微生物菌群，利用凡纳滨对虾体内感染模型，探究共生微生物与病原菌特异性噬菌体在抑制副溶血性弧菌中的协同互作。
源自凡纳滨对虾肌球蛋白的新型群体感应抑制肽SF抑制副溶血弧菌生物膜形成和毒力因子
副溶血弧菌是水产品中常见致病菌，其生物膜形成与毒力受AI-2/LuxS群体感应系统调控。本研究通过分子对接从凡纳滨对虾肌球蛋白水解产物中筛选出新型群体感应抑制肽SF（丝氨酸-苯丙氨酸），在亚抑菌浓度下可显著抑制副溶血弧菌AI-2活性与生物膜形成，破坏生物膜结构，降低胞外多糖、卵磷脂酶、蛋白酶、淀粉酶分泌，并抑制细菌群集与泳动能力；RT-qPCR证实SF可下调群体感应、毒力及生物膜相关基因表达，表明SF可作为控制副溶血弧菌生物膜与毒力的新型群体感应抑制剂。
牛中曼海姆溶血菌囊膜和粘附蛋白突变体的黏膜定植
曼海姆溶血菌是牛呼吸道疾病的主要致病菌，多糖囊膜与表面粘附蛋白被认为参与其上呼吸道黏膜黏附与定植过程。研究证实囊膜是曼海姆溶血菌长期定植必需因子，粘附蛋白缺失反而增强定植能力，为牛呼吸道疾病防控与疫苗研发提供靶点。
利用黑腹果蝇开展分枝杆菌毒力全基因组表型研究
本文以黑腹果蝇为感染模型，以海洋分枝杆菌为研究对象，验证果蝇作为分枝杆菌毒力研究模型的适用性，通过转座子插入测序全基因组筛选分枝杆菌毒力基因，发现181个毒力基因，其中91%在结核分枝杆菌中存在直系同源基因；对mmar_1660及其结核分枝杆菌同源基因rv3041c进行验证，证实二者通过调控铁获取参与分枝杆菌在果蝇及人巨噬细胞内的毒力过程，证明果蝇模型可用于挖掘结核分枝杆菌毒力机制，为抗结核药物与疫苗研发提供靶点。
普城沙雷氏菌的卓越血红素耐受性：埃及伊蚊中肠氧化应激适应的蛋白质组学见解
从埃及伊蚊中肠分离的普城沙雷氏菌对血液消化产生的毒性副产物氯化血红素具有显著耐受能力。本研究模拟中肠环境，采用5 mM氯化血红素诱导氧化应激，通过蛋白质组学探究其适应机制。生长实验表明该菌可耐受5 μM至1 mM氯化血红素，约10小时进入稳定期，菌落出现边缘变暗、透明晕环等形态变化，提示血红素积累与解毒。
HrcA介导的转录调控影响猪链球菌在低血糖条件下的生长和存活
猪链球菌是重要人兽共患病原菌，其在宿主鼻咽部低血糖微环境的定植依赖适应性调控，但相关分子机制尚不明确。本研究通过转录组测序发现低血糖条件下猪链球菌有86个差异表达基因，主要集中在磷酸转移酶系统、替代碳代谢和能量稳态通路；对8个转录因子突变体表型筛选显示，缺失HrcA会显著损害细菌在低血糖下的生长和存活；
在小牛肺攻毒模型中，曼海姆溶血菌同源囊膜和LPS-硅化基因缺失突变体毒力减弱
牛呼吸道疾病综合征是养牛业重大经济损失的主要原因，曼海姆溶血菌是其最主要致病菌。本研究构建曼海姆溶血菌1型囊膜缺失突变体Δcap与脂多糖硅化缺失突变体ΔneuA，通过小牛肺攻毒模型评估毒力。
微菌素Y在肠炎沙门氏菌鼠伤寒血清型中的抗性机制及生理效应
沙门氏菌因其高毒力和多重耐药性对畜牧业和人类健康构成严重威胁，套索肽MccY是一种新型抗沙门氏菌抗菌肽。本研究构建了鼠伤寒沙门氏菌Ton系统（tonB、exbB、exbD）和Tol-Pal系统的基因缺失突变体，发现Ton系统任意基因的缺失会使MccY的最低抑菌浓度（MIC）升高2000倍，而Tol-Pal系统突变不影响MccY敏感性。
广谱裂解性噬菌体PG288的特性鉴定与基因组分析——一种潜在的弧菌感染天然治疗候选物
副溶血性弧菌是重要的人畜共患病原体，可导致水产动物和人类严重疾病甚至死亡，而抗生素的广泛使用使其疗效持续下降，可特异性裂解细菌的噬菌体作为新型抗菌替代策略受到广泛关注。本研究对以副溶血性弧菌G855为宿主的裂解性噬菌体PG288进行了系统鉴定与分析
比较蛋白质组学与分泌组学揭示16种食用水产品来源非O1/O139群霍乱弧菌的毒力与共耐药相关因子
霍乱弧菌是可引发人类霍乱大流行的革兰氏阴性菌，广泛分布于全球水生环境中，鉴定水产品中霍乱弧菌的风险因子对保障食品安全至关重要。本研究对分离自16种食用水产品的20株非O1/O139群霍乱弧菌，完成了毒力相关基因检测、抗生素与重金属交叉耐药表型分析及基因组指纹图谱分析；
全基因组分析揭示 PhoP 对鸭疫里默氏菌致病性的调控作用
针对水禽重要致病菌鸭疫里默氏菌的毒力调控机制空白，以 PhoPR 双组分系统为核心研究对象，首次结合 DNA 亲和纯化测序（DAP-seq）与转录组测序（RNA-seq）技术，在全基因组范围内绘制了响应调控因子 PhoP 的直接结合图谱，鉴定了其核心靶基因与保守结合基序。研究通过同源重组构建了 phoP 和 phoR 单基因敲除菌株，解析了两者的转录调控谱差异，揭示了 PhoP 通过直接调控 Bat 操纵子介导菌株氧化应激耐受、进而调控致病性的全新机制，并通过雏鸭感染模型证实 phoP 和 phoR 是该菌的关键毒力决定因子。