利用裂菌体和柠檬酸联合防治海鲜中副溶血性弧菌
副溶血性弧菌是水产类典型食源性致病菌，极易在食材、加工器具形成生物膜，冷链温度波动会快速增殖引发食物中毒。常规化学、抗生素防控易造成残留与耐药菌问题。本研究分离5株裂解型副溶血性弧噬菌体，完成全基因组测序与安全评估；构建噬菌体混合鸡尾酒VPpMIx，搭配食品级柠檬酸组成复合抑菌体系。
一条新型糖异生途径使人畜共患布鲁氏菌高效利用赤藓糖醇
布鲁氏菌是高危害人畜共患病原，偏好畜禽胎盘、生殖道富集的赤藓糖醇，可大量增殖引发流产。已知经典果糖二磷酸酶Fbp、GlpX缺失株仍可利用3/4碳底物，提示存在未知糖异生通路。本研究以猪布鲁氏菌5型513株为模式，鉴定出果糖二磷酸醛缩酶Fba、新型广谱磷酸酶Bbp；发现Fba可催化赤藓糖4-磷酸（E4P）生成景天庚酮糖1,7-二磷酸（S1,7bP），Bbp可水解该中间产物，搭建全新景天庚酮旁路糖异生通路。
鸡伤寒沙门氏菌mgtC突变株会延缓鸡伤寒病程进展
mgtC是沙门氏菌致病岛SPI3关键毒力基因，在鼠伤寒沙门氏菌感染小鼠模型中，该基因缺失会显著致弱菌株毒力。本研究构建鸡伤寒沙门氏菌野生株wt-SG与mgtC敲除突变株SG ΔmgtC，结合体外细胞试验、21日龄雏鸡体内攻毒模型，探究mgtC对鸡伤寒致病作用。
3株人暴发分离株与1株牛源产志贺毒素大肠杆菌O157:H7表型及基因组对比研究
牛是O157:H7主要贮存宿主，该菌可经食品传播引发人类出血性肠炎、溶血尿毒综合征（HUS），但目前人致病株与牛源菌株的基因组、表型关联性尚不清晰。研究选取3株关联人类食源性暴发菌株（EDL933、TW14588、RM6067W）、1株健康奶牛粪便分离非暴发株FRIK1989，从全基因组、体外生长、细胞粘附、生物膜、毒素毒性、牛体内定植多维度对比差异。
金属结合蛋白三价疫苗在小鼠感染模型中提供肠球菌抗感染保护作用
粪肠球菌、屎肠球菌是临床高风险多重耐药条件致病菌，引发尿路感染、败血症、心内膜炎，目前尚无上市疫苗。该研究选取粪肠球菌3种关键金属转运脂蛋白EfaA（锰摄取）、AdcA/AdcAII（锌摄取）作为抗原，构建单价、二价、三价免疫体系开展体外与体内验证。
地衣芽孢杆菌PF9防控断奶仔猪产肠毒素大肠杆菌的功能潜力评价
断奶仔猪腹泻（PWD）主要由F4型产肠毒素大肠杆菌（ETEC）引发，抗生素促生长添加剂限用后亟需益生菌替代方案。本研究从散养无抗猪场粪便分离耐热地衣芽孢杆菌PF9，先开展体外特性验证，再构建ETEC攻毒断奶仔猪动物模型，设置空白对照组、攻毒阴性组、抗生素安普霉素阳性组、PF9益生菌组四组试验。
BvgR、RisA、RisS对支气管败血波氏杆菌全局基因调控、胞内c-di-GMP水平、运动能力及生
支气管败血波氏杆菌是人畜共患高传染性呼吸道致病菌，Bvg二元系统是其核心毒力调控通路，可介导细菌在毒力型（Bvg+）、非毒力型（Bvg-）表型间切换。本研究构建ΔbvgR、ΔrisA、ΔrisS、ΔrisAS及RisA磷酸化缺陷突变株risAD60N，结合RNA-seq转录组、LC-MS/MS环二鸟苷酸定量、运动与生物膜表型试验，系统解析BvgR、RisS/RisA二元系统及其磷酸化修饰的全局调控功能。
用于评估商业猪群中增殖性肠病控制的流行病学工具
猪增生性肠炎（PE）由胞内劳森菌引起，造成生长迟缓、出血性肠炎与猪场重大经济损失，现有防控研究多在实验室攻毒条件开展，难以贴合规模化猪场反复感染、高密度养殖真实场景。本研究在澳大利亚大型商品猪场设置84个猪栏、7种防控处理分组，依托粪便qPCR、血清ELISA两类流行病学监测工具，全程跟踪9~22周育肥猪劳森菌排菌量、血清抗体、生长生产指标，对比石灰消毒、口服疫苗、不同剂量喹乙醇单独/联合方案的田间防控效果。
两株新分离的爱德华氏噬菌体对杀鱼爱德华氏菌感染的治疗效果
水产养殖中多重耐药细菌的传播带来严重威胁，噬菌体疗法因杀菌效果优异，成为替代抗生素的可行方案。本研究从污水中分离得到两株新型杀鱼爱德华氏噬菌体vB_EpM_ZHS和vB_EpP_ZHX，经形态与基因组鉴定，二者分别归属于肌尾噬菌体科和短尾噬菌体科。两种噬菌体复配使用后，体外抑菌和体内治疗效果均得到提升。
氧化还原类药物甲硝唑与耗硫大蒜化合物对涡旋旋核原虫具有协同作用
涡旋旋核原虫是一种原生动物寄生虫，会导致淡水神仙鱼大量死亡。由于法规限制，水产养殖中主流治疗药物甲硝唑的使用受到制约。大蒜提取物具备良好的抗菌抗寄生虫活性，本研究选取大蒜活性成分阿焦烯油开展相关试验。体外检测结果显示，阿焦烯油对涡旋旋核原虫的最低抑菌浓度为40 μg/ml，经气相色谱、核磁共振分析证实该提取物含有(E)型、(Z)型阿焦烯以及二烯丙基二硫醚、二烯丙基三硫醚等成分，其中仅(Z)型阿焦烯具备显著抑虫活性，最低抑菌浓度为16 μg/ml。
利用高通量筛选方法合成与评估从海洋宏基因组提取的水生抗菌肽
本研究针对水产养殖中细菌性疾病频发与抗生素耐药问题，采用机器学习模型从凡纳滨对虾养殖池塘宏基因组中预测抗菌肽，传统土塘每兆碱基抗菌肽含量高于生物絮塘与高位池。共预测1033条潜在抗菌肽，经结构与理化性质筛选得到10条候选肽，通过无细胞蛋白表达系统高通量筛选出9条具有抗菌活性的肽，最终化学合成3条（K-5、K-58、K-61）。
抗菌物质丹皮酚调控嗜水气单胞菌外排泵与膜通透性：蛋白质组学见解及在草鱼肉保鲜中的应用
丹皮酚是具有抗菌潜力的天然植物化合物，本研究发现其对嗜水气单胞菌的半抑制浓度IC50为256.8 μg/mL，可抑制12株细菌生长。丹皮酚通过降低细菌运动性、抑制生物膜形成、增强细胞膜通透性、降低外排泵活性发挥抗菌作用。蛋白质组学显示，丹皮酚处理后外排泵相关蛋白上调、ABC转运蛋白下调，与外排泵抑制剂CCCP联用可增强抗菌效果。
鱼型爱德华氏菌中ArgR依赖的细菌对宿主脂滴的抗性
脂滴作为天然免疫枢纽参与宿主抗菌防御，胞内病原菌需抵抗宿主脂滴才能完成定植与免疫逃逸。本研究以鱼型爱德华氏菌为对象，利用转座子插入测序筛选其抵抗大菱鲆宿主脂滴的关键基因，发现脂滴胁迫会导致细菌胞内精氨酸积累，精氨酸代谢核心调控因子ArgR通过调控精氨酸分解代谢、合成与转运相关基因表达维持胞内精氨酸稳态，帮助细菌抵抗脂滴杀伤。
共生菌与噬菌体捕食在抑制致病性副溶血性弧菌定植中的协同作用
定植抵抗是微生物组抑制病原菌入侵的核心机制，但其生态与分子决定因素尚未完全明确。本研究构建明确的微生物菌群，利用凡纳滨对虾体内感染模型，探究共生微生物与病原菌特异性噬菌体在抑制副溶血性弧菌中的协同互作。
源自凡纳滨对虾肌球蛋白的新型群体感应抑制肽SF抑制副溶血弧菌生物膜形成和毒力因子
副溶血弧菌是水产品中常见致病菌，其生物膜形成与毒力受AI-2/LuxS群体感应系统调控。本研究通过分子对接从凡纳滨对虾肌球蛋白水解产物中筛选出新型群体感应抑制肽SF（丝氨酸-苯丙氨酸），在亚抑菌浓度下可显著抑制副溶血弧菌AI-2活性与生物膜形成，破坏生物膜结构，降低胞外多糖、卵磷脂酶、蛋白酶、淀粉酶分泌，并抑制细菌群集与泳动能力；RT-qPCR证实SF可下调群体感应、毒力及生物膜相关基因表达，表明SF可作为控制副溶血弧菌生物膜与毒力的新型群体感应抑制剂。
牛中曼海姆溶血菌囊膜和粘附蛋白突变体的黏膜定植
曼海姆溶血菌是牛呼吸道疾病的主要致病菌，多糖囊膜与表面粘附蛋白被认为参与其上呼吸道黏膜黏附与定植过程。研究证实囊膜是曼海姆溶血菌长期定植必需因子，粘附蛋白缺失反而增强定植能力，为牛呼吸道疾病防控与疫苗研发提供靶点。
利用黑腹果蝇开展分枝杆菌毒力全基因组表型研究
本文以黑腹果蝇为感染模型，以海洋分枝杆菌为研究对象，验证果蝇作为分枝杆菌毒力研究模型的适用性，通过转座子插入测序全基因组筛选分枝杆菌毒力基因，发现181个毒力基因，其中91%在结核分枝杆菌中存在直系同源基因；对mmar_1660及其结核分枝杆菌同源基因rv3041c进行验证，证实二者通过调控铁获取参与分枝杆菌在果蝇及人巨噬细胞内的毒力过程，证明果蝇模型可用于挖掘结核分枝杆菌毒力机制，为抗结核药物与疫苗研发提供靶点。
普城沙雷氏菌的卓越血红素耐受性：埃及伊蚊中肠氧化应激适应的蛋白质组学见解
从埃及伊蚊中肠分离的普城沙雷氏菌对血液消化产生的毒性副产物氯化血红素具有显著耐受能力。本研究模拟中肠环境，采用5 mM氯化血红素诱导氧化应激，通过蛋白质组学探究其适应机制。生长实验表明该菌可耐受5 μM至1 mM氯化血红素，约10小时进入稳定期，菌落出现边缘变暗、透明晕环等形态变化，提示血红素积累与解毒。
HrcA介导的转录调控影响猪链球菌在低血糖条件下的生长和存活
猪链球菌是重要人兽共患病原菌，其在宿主鼻咽部低血糖微环境的定植依赖适应性调控，但相关分子机制尚不明确。本研究通过转录组测序发现低血糖条件下猪链球菌有86个差异表达基因，主要集中在磷酸转移酶系统、替代碳代谢和能量稳态通路；对8个转录因子突变体表型筛选显示，缺失HrcA会显著损害细菌在低血糖下的生长和存活；
在小牛肺攻毒模型中，曼海姆溶血菌同源囊膜和LPS-硅化基因缺失突变体毒力减弱
牛呼吸道疾病综合征是养牛业重大经济损失的主要原因，曼海姆溶血菌是其最主要致病菌。本研究构建曼海姆溶血菌1型囊膜缺失突变体Δcap与脂多糖硅化缺失突变体ΔneuA，通过小牛肺攻毒模型评估毒力。