嗜窄温性兼性嗜热厌氧梭菌AK1菌株产乙醇和1,2-丙二醇的数据集
本数据集报道了嗜窄温性兼性嗜热厌氧梭菌AK1菌株对D-葡萄糖、L-鼠李糖、L-岩藻糖的发酵特性及产物生成情况。研究考察底物浓度、初始pH、培养温度、液气相比、磷酸盐浓度对发酵产物的影响。
深海Myroides profundi D25菌株由陆生向海洋迁移过程中的早期基因组演化与异域物种形
每年大量陆生细菌随径流汇入海洋，但多数难以存活，少数可在海洋定殖，其环境适应分子机制尚不明确。Myroides profundi D25分离自冲绳海槽深海沉积物，与人源条件致病菌Myroides odoratimimus基因组同源性极高，提示该菌近期由陆生环境迁入海洋。
应激诱导泛素同源蛋白Hub1上调调控前体mRNA剪接并提升酿酒镉耐受性
前体mRNA剪接是真核生物基因表达的关键过程，DEAD-box RNA解旋酶参与调控剪接保真度。泛素同源蛋白Hub1可结合剪接关键因子Prp5并激活其ATP酶活性，过表达Hub1能提升剪接效率、放宽剪接位点限制，但其生理功能尚不明确。本研究发现，氧化应激、重金属镉胁迫可通过酵母AP1（Yap1）调控子在转录水平上调Hub1表达；镉胁迫下，上调的Hub1能够促进含非典型剪接位点内含子的剪接。
北极污灰假交替单胞菌中Csr小RNA的动态且复杂调控
本研究在北极污灰假交替单胞菌BSW20308中发现两个新的Csr系统小RNA Pf2与Pf3，连同已知的Pf1共同构成三条Csr sRNA。它们通过竞争性结合CsrA蛋白，全局调控细菌的运动性、生物被膜、六型分泌系统、外膜应激、碳代谢等多种生理过程。缺失不同数量的Pf sRNA会显著改变CsrA的靶标谱，表现出功能互补与补偿效应。
被MarR家族调控因子抑制的细胞色素bd在紫色色杆菌中赋予对金属、一氧化氮、硫化物和氰化物的抗性
紫色色杆菌是一种普遍存在的环境病原体，尽管其适应性极强，但对其胁迫抗性机制知之甚少。本研究在筛选铁敏感转座子突变体时，鉴定出一种细胞色素bd（CioAB）可保护紫色色杆菌抵御多种胁迫。该细胞色素bd的两个亚基由cioRAB操纵子编码，该操纵子还编码GbsR型MarR家族转录因子CioR。∆cioAB突变株对铁和需铁抗生素链黑菌素敏感，且铁载体产量下降。
通过定量表型分析系统解析古菌转录因子在调控网络中的功能
基因调控网络（GRNs）对环境胁迫下的动态转录响应至关重要，但GRN调控如何调整细胞生理以实现胁迫存活的机制尚不明确。本研究以高胁迫耐受性古菌盐生盐杆菌（*Halobacterium salinarum*）为研究对象，测定了27个转录因子（TF）缺失突变体在热激、氧化胁迫、低盐条件下的高时间分辨率生长表型。