碳青霉烯耐药高致病性肺炎克雷伯菌中携带blaNDM质粒的传播
本研究对中国某三甲医院2019–2021年分离的59株碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌（CRKP）进行耐药表型与基因组分析，发现菌株均为多重耐药但对多黏菌素、替加环素敏感。主要序列型为ST11（39/59）与ST15（12/59），碳青霉烯酶基因以blaKPC-2与blaNDM为主。18株blaNDM阳性菌中，质粒主要为IncX3型，可高效接合转移、几乎无适应度代价且传代稳定。
转录调控因子AHA_4052调控嗜水气单胞菌的氨基糖苷类耐药性
本文围绕嗜水气单胞菌多重耐药性问题展开，针对OmpR/PhoB家族转录调控因子AHA_4052开展研究，构建该基因敲除株与回补株，探究其在环境胁迫耐受与抗生素耐药中的作用。
一种适用于冷冻电镜解析多构象小型MFS转运蛋白结构的基质辅助策略
本研究开发了一种利用AlphaFold2在主要协助超家族（MFS）膜转运蛋白C端融合刚性BRIL结构域的通用策略，通过短聚丙氨酸连接肽实现跨膜螺旋刚性延伸。结合BRIL特异性Fab，从单一样品中解析出42kDa金黄色葡萄球菌NorA的4种构象（内向开放、内向闭塞、闭塞、外向开放），分辨率达2.56–3.25Å。
亚致死相互作用因子（SIF），一种基于生长分析亚抑制浓度下抗生素组合的方法
本研究建立了亚致死相互作用因子（SIF）检测方法，基于Bliss独立模型，利用完整生长曲线的曲线下面积（AUC）定量分析亚抑制浓度下两种抗生素的相互作用（协同、相加、拮抗）。该方法无需依赖致死浓度，可覆盖细菌整个生长周期，包括迟滞期与稳定期。
新型弯曲杆菌噬菌体CC_R7作为鸡肉生物防治剂的特性描述与应用
本研究调查了空肠弯曲杆菌与结肠弯曲杆菌的耐药模式，分离并鉴定新型裂解性弯曲杆菌噬菌体CC_R7，完成全基因组分析与生物学特性表征。结果显示结肠弯曲杆菌耐药率高于空肠弯曲杆菌。该噬菌体可抑制生物膜形成，在鸡肉中可将弯曲杆菌污染量降低1.2 log CFU/g，适合作为食品中多重耐药弯曲杆菌的生物防治剂。
新德里金属β-内酰胺酶1的膜锚定改变大肠杆菌适应性并通过诱导外膜失稳增加其对多黏菌素的敏感性
本研究发现表达blaNDM-1的大肠杆菌在高渗透压胁迫下存在显著生长缺陷，该适应度代价源于NDM-1通过前导肽锚定细菌外膜并破坏外膜稳定性。将膜锚定位点Cys26突变为丙氨酸可恢复外膜稳定性并缓解细菌适应度代价。
携带mcr质粒的基因组多样性及IV型分泌系统在IncI2质粒接合中的作用
本研究分析868个完整mcr质粒序列，揭示mcr质粒具有多样复制子类型，其中IncI2为主要流行型，IncHI2型伴随多重耐药基因共转移风险。89.9%的mcr质粒携带IV型分泌系统（T4SS），其中IncI2质粒专属的T4SSP3为保守的典型VirB/D4型，含12个亚基。
携带blaIMP的碳青霉烯耐药大肠杆菌的全球流行病学与遗传特征
本研究整合本地与全球监测数据，对携带blaIMP的碳青霉烯耐药大肠杆菌（CREC）开展全面分析。对中国浙江4家三甲医院2017-2024年收集的94株CREC中9株blaIMP-4阳性菌株进行全基因组测序、药敏、质粒接合、稳定性与适应度实验。这些菌株呈多重耐药，但对多黏菌素、替加环素、阿米卡星敏感，分属7种ST型，首次检出高风险克隆ST1193。
稳定突变通过拓宽突变景观增强BlaC β-内酰胺酶的进化能力
本研究在结核分枝杆菌BlaC β-内酰胺酶中鉴定出I105F、H184R、V263I三种稳定突变，它们可共同完全恢复高度不稳定突变体对羧苄西林的抗性。体外表征显示这三种突变均提升蛋白质热稳定性与化学稳定性，使大肠杆菌周质中酶表达量显著上升。稳定突变的引入大幅增强酶的进化能力，允许野生型无法访问的突变通路进化出头孢曲松水解活性，部分新功能突变不会严重损害青霉素抗性。
通过动态协方差映射量化微生物组内物种及物种间群落相互作用
本研究建立动态协方差映射（DCM）方法，可从微生物丰度时间序列数据直接推断群落互作矩阵与稳定性。结合高分辨率染色体条形码技术，在无菌、抗生素扰动、天然菌群三种小鼠肠道模型中，同时量化大肠杆菌定植过程中的种内与种间相互作用。结果识别出定植的三个典型阶段：入侵失稳、本土菌群部分重建、克隆亚系与常驻菌准稳态共存，这些阶段由大肠杆菌克隆簇与群落成员的特异性互作驱动。
产KPC-33型碳青霉烯和头孢他啶-阿维巴坦耐药铜绿假单胞菌的全球系统地理学与遗传特征
本研究追踪了同一患者体内由KPC-2型铜绿假单胞菌经头孢他啶-阿维巴坦治疗后突变为KPC-33型的临床进化过程，证实blaKPC-33由blaKPC-2的D179Y突变产生，介导对头孢他啶-阿维巴坦耐药并呈现碳青霉烯敏感性回升的跷跷板效应。全球分析显示产KPC铜绿假单胞菌主要分布于中国与美国，ST463为中国优势克隆且仅在中国流行。
一种含2-氨基恶唑的新型杀菌氯代衍生物增强多黏菌素对多重耐药鲍曼不动杆菌的抗菌作用
本研究评估新型氯代衍生物AB15作为抗菌佐剂的潜力，其对多重耐药鲍曼不动杆菌具有杀菌活性，MIC范围15.63–62.5 μM，体外与体内均低毒。AB15与最后一线药物多黏菌素联用呈现相加与协同作用，可显著抑制细菌从生物膜扩散，引入最小生物膜扩散浓度MBDC参数。
探索索利霉素作为抗金黄色葡萄球菌及其耐药变异株抗毒力因子的再利用作用
本研究探究新一代酮内酯类抗生素索利霉素（SOL）作为抗毒力药物，对金黄色葡萄球菌、耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）及agrA缺失株（ΔagrA）的作用效果。SOL对三种菌株均显示强效抗菌活性，MIC₉₀为0.8 μg/mL，MIC₅₀为0.4 μg/mL。亚抑菌浓度下，SOL可显著抑制细菌运动能力、蛋白酶分泌与生物膜形成，扫描电镜与共聚焦显微镜观察到生物膜结构明显破坏，PCR检测显示毒力基因表达受抑，且未检出杀白细胞素基因。
凝集素-Fc（IgG）融合蛋白对新兴多重耐药病原体耳念珠菌具有抗真菌活性
本研究评估了三种凝集素-Fc（IgG）融合蛋白（Dectin-1-Fc(IgG2a)、Dectin-1-Fc(IgG2b)、麦胚凝集素WGA-Fc(IgG2a)）对耐氟康唑耳念珠菌的抗真菌与免疫调节作用。三种蛋白均可剂量依赖性结合耳念珠菌细胞壁的β-1,3-葡聚糖与几丁质，抑制真菌生长与生物膜形成，并作为调理素增强巨噬细胞吞噬与杀伤能力。
难治性耐药铜绿假单胞菌共产AFM与KPC碳青霉烯酶的新型耐药威胁：质粒动态转移及全球系统地理分布
本研究在中国两家医院院区发现同时产AFM与KPC-2碳青霉烯酶的难治性耐药铜绿假单胞菌，证实携带blaAFM-2的质粒可水平转移，推动双重碳青霉烯酶菌株的出现。患者跨病区转运与交叉护理可能促进耐药株传播。接合实验确认blaAFM-2质粒可转入铜绿假单胞菌PAO1。
耐甲氧西林金黄色葡萄球菌ST9谱系毒力塑造与适应性特征
本研究针对9株临床ST9型耐甲氧西林金黄色葡萄球菌展开分析，发现2株在agr群体感应系统存在自发移码突变，导致RNAIII与α-毒素表达丧失、溶血活性下降、生物膜形成增强且大蜡螟幼虫感染模型中毒力减弱。比较基因组显示ST9谱系具有独特的致病岛特征，同时鉴定出3个新型前噬菌体岛φST9-A、φST9-B、φST9-C，其中φST9-B携带毒力基因tarP。
磷酸根离子调节两种耐克拉维酸β-内酰胺酶突变体中的酶活性与上位效应
本研究探究结核分枝杆菌BlaC β-内酰胺酶的两种耐克拉维酸双突变体I105Y-S130G与I105G-G132N的上位效应分子机制。结果显示，105位看门残基突变可正向补偿130/132位突变导致的催化活性下降，表现出显著正上位效应；而在克拉维酸抑制上则呈现负上位。上位效应强度高度依赖缓冲体系，磷酸根离子可显著改变酶活性、抑制恢复与上位效应方向。
裂解噬菌体中耐甲氧苄啶dfrA基因的进化选择影响感染期间噬菌体与宿主的适应性
本研究采用宽松阈值搜索与基于结构相似性的机器学习配对比较建模方法，在26697个噬菌体基因组中鉴定出11665个潜在抗生素耐药基因，其中9419个位于裂解噬菌体。功能验证显示，裂解噬菌体富集的dfrA基因可赋予大肠杆菌甲氧苄啶抗性。
抗生素耐药决定因子对细菌死亡率的影响是什么？
本研究探究抗生素耐药决定因子对杀菌性抗生素作用下细菌死亡速率的影响。大肠杆菌在氨苄西林作用下呈现双相死亡：初期快速指数衰减，随后进入缓慢持续衰减阶段。对萘啶酸或利福平单一耐药突变株在初期死亡快于敏感菌，双重耐药突变株则存活更久，显示上位效应。
抗生素耐药性鲍曼不动杆菌可通过噬菌体与补体的组合杀伤
本研究证实噬菌体与补体系统协同杀伤多重耐药鲍曼不动杆菌。鲍曼不动杆菌可通过调控荚膜与脂寡糖表达快速适应并对噬菌体或补体产生抗性，该过程由K基因座中可逆转座子突变介导。无荚膜的噬菌体抗性株更容易被补体膜攻击复合物（C5b-9）沉积并被补体杀伤；而有荚膜表型可通过将膜攻击复合物脱落到环境中逃避补体攻击。