啤酒花内生菌——聚团泛菌水解动物源与食物废弃物并释放氨气
本研究以啤酒花内生菌*Pantoea agglomerans* DBM 3797为对象，探究其利用动物废弃物（鸡毛、鸡肉下脚料、鲤鱼加工副产物）与啤酒废酵母水解液进行氨化作用的能力。结果显示，该菌株可将水解液中的氨基酸与多肽转化并释放高浓度铵根离子（NH₄⁺），其中鸡毛碱性水解液单位原料产铵最高（41.20 mg/g），鸡毛酸性水解液总铵浓度最高（0.943 g/L）。
马胃葡萄球菌菌株水平多样性影响秦岭干发酵香肠的品质特征与风味轮廓
本研究从优质自然发酵肉制品中分离鉴定出4株产风味马胃葡萄球菌（*S. equorum*），以秦岭黑猪肉为原料，研究多菌株复合发酵剂对干发酵香肠品质与风味的影响。结果表明，与不接种或低多样性菌株组相比，接种4株*S. equorum*的香肠pH更高，奶油香、花香、果香、肉香更浓郁，酸味降低、鲜味提升；挥发性风味物质中辛酸甲酯、丁酸甲酯、3-羟基-2-丁酮等特征风味含量显著升高。
植物乳杆菌与酿酒酵母共发酵提升成熟椰子水风味特征：基于挥发性与非挥发性轮廓的解析
成熟椰子水营养丰富但酸涩味重、口感差，难以直接饮用。本研究构建植物乳杆菌A33+酿酒酵母1–7-1共发酵体系，显著改善成熟椰子水的风味与感官品质。与单菌发酵相比，共发酵大幅提升挥发性风味物质总量，形成以异戊醇、辛酸乙酯、癸酸乙酯、辛酸、乙酸异戊酯为主的花果香特征风味；电子鼻与电子舌证实香气层次更丰富、滋味更醇厚。
从自发发酵及生食产品中分离的清酒乳杆菌F1、副干酪乳杆菌D2、鼠李糖乳杆菌JL、食魏斯氏菌JLK的分
本研究从发酵食品与生食蔬菜中分离得到50株乳酸菌，通过DPPH、ABTS自由基清除实验筛选出4株抗氧化性能突出的菌株：清酒乳杆菌F1、副干酪乳杆菌D2、鼠李糖乳杆菌JL、食魏斯氏菌JLK。进一步测定其过氧化氢耐受性，并结合全基因组测序与转录组分析，探究抗氧化分子机制。
SOD1缺乏揭示酿酒酵母中香草醛毒性的间接氧化还原应激机制
香草醛是广泛应用于食品与化妆品的风味物质，也是木质纤维素水解产物中典型的发酵抑制剂，其对酵母细胞的毒性机制尚未完全阐明。本研究以野生型和SOD1缺失（Δsod1）酿酒酵母为模型，探究香草醛引发毒性的分子基础。
本地微生物菌株在腰果苹果汁混合培养发酵中的表征与应用
本研究从贝宁自然发酵腰果苹果制品中分离出52株本土微生物（34株酵母、14株乳酸菌、4株醋酸菌），经分子鉴定为酿酒酵母、库德里阿兹威毕赤酵母、仙人掌 Hanseniaspora、植物乳杆菌、巴氏醋杆菌等。
ccpA在氮源诱导的鼠李糖乳杆菌热胁迫与氧化胁迫耐受性变化中的作用
本研究以鼠李糖乳杆菌hsryfm 1301及其ccpA基因缺失株ΔccpA为对象，探究ccpA在不同氮源条件下对菌体热胁迫和氧化胁迫耐受性的调控作用。结果显示，ΔccpA在MRS培养基中生长变慢、耐热性下降，但抗氧化胁迫能力显著提升；转录组表明缺失ccpA主要影响碳源转运与代谢相关基因，不调控典型胁迫基因。
新型抗菌剂苯并噻唑啉酮防治梨火疫病的效果评价
梨火疫病是由梨火疫欧文氏菌引起的毁灭性细菌性病害，长期使用抗生素导致抗性问题突出。本研究系统评价了我国自主创制的新型杀菌剂苯并噻唑啉酮对梨火疫病的防控潜力。结果显示，苯并噻唑啉酮对梨火疫病菌的EC₅₀为0.48–0.67 μg/mL，具有广谱抗细菌、抗真菌活性。
细菌传感器通过降低复杂度完成进化
细菌胞外配体结合结构域（LBD）以Cache结构域最为普遍，分为单模块sCache与双模块dCache。传统观点认为传感器进化以复杂度增加为主，而本研究提出相反机制。在植物病原菌黑胫欧文氏菌中鉴定到甲酸特异性趋化受体PacF，其配体结合结构域为双模块dCache（Cache_3–Cache_2），甲酸仅结合在远离膜的模块上。
西瓜嗜酸菌中功能性HipBA毒素-抗毒素系统的证据
细菌性果斑病（BFB）是由革兰氏阴性菌西瓜嗜酸菌引起的毁灭性种传病害，给全球葫芦科产业造成了重大经济损失，但该病原菌的致病分子机制仍不明确。毒素-抗毒素（TA）系统是细菌应对环境胁迫的关键调控元件，由编码稳定毒素蛋白和不稳定抗毒素蛋白的两个相邻基因组成。
唐菖蒲伯克霍尔德菌在洋葱叶片和鳞茎鳞片组织中的独特毒力机制
唐菖蒲伯克霍尔德菌洋葱致病变种（Bga）引起的洋葱滑皮病是全球洋葱产区常见的细菌性病害，但其毒力机制研究仍十分有限。本研究以Bga菌株20GA0385为对象，采用反向遗传学方法，以近缘水稻病原菌唐菖蒲伯克霍尔德菌为参考进行比较基因组学分析，鉴定候选毒力因子和调控因子。
来自不同荚膜组织胞浆菌菌株的细胞外囊泡调节吞噬细胞功能并促进真菌持续性感染
本研究探究了荚膜组织胞浆菌两种表型与基因型均不同的菌株（G-217B、G-184A）所释放的细胞外囊泡（EVs）对小鼠骨髓源巨噬细胞（BMDMs）和树突状细胞（BMDCs）的调控作用。两种宿主细胞均可内吞该真菌EVs，并引发不同的功能应答。
植物相关细菌中的一类化学感受器家族优先响应植物信号分子3-磷酸甘油
细菌对植物化合物的趋化作用是其定殖植物的初始步骤，植物病原菌和植物相关细菌含有的化学感受器数量约为普通细菌的两倍，表明趋化对细菌–植物互作至关重要，但相关感受器与效应分子信息仍然有限。本研究从黑胫病病原菌Pectobacterium atrosepticum中鉴定出化学感受器PacP，其sCache配体结合结构域可特异性识别磷酸化C3化合物并介导趋化吸引。
揭示一株新型噬菌体侵染园艺黄单胞菌莴苣致病变种的宿主互作与进化限制因素
本研究分离并鉴定了一株裂解性噬菌体ΦXhv-1，属于有尾噬菌体纲的一个新属。利用转座子插入测序（Tn-seq）鉴定出36个对噬菌体侵染必需的细菌基因，主要参与脂多糖（LPS）合成与表面多糖修饰。定点突变与荧光显微镜证实，ΦXhv-1吸附于LPS的O-抗原侧链特定残基。噬菌体抗性突变体在体外运动能力下降，且在植物体内毒力显著降低。
基于大蒜提取物的二硫化物衍生物合成及作为Ⅲ型分泌系统抑制剂抗梨火疫病菌的生物学评价
梨火疫病由梨火疫欧文氏菌（*Erwinia amylovora*）引起，严重威胁蔷薇科果树生产。Ⅲ型分泌系统（T3SS）是该菌关键致病因子，可向植物细胞分泌效应蛋白引发病害。本研究以大蒜提取物中的二硫键活性结构为母体，设计合成39个二硫化物小分子，利用*lux*发光报告系统高通量筛选T3SS抑制剂。
黄单胞苷芳基多烯的结构多样性及黄单胞菌植物病原合成所需基因的功能分析
黄单胞菌属是一类可侵染400余种植物的革兰氏阴性植物病原细菌，其标志性特征是产生黄色膜结合色素——黄单胞苷（xanthomonadin）。本研究对5个物种共24株黄单胞菌进行芳基多烯甲酯（MEAP）制备，经HPLC与Q-TOF–MS鉴定出3种主要MEAP：双溴甲基化MEAP-1、双溴非甲基化MEAP-2、单溴非甲基化MEAP-3，并据此将菌株分为3类。
大麦中两种主要植物毒性生物碱的微生物降解
大麦会产生大麦芽碱和芦竹碱两种植物毒性生物碱作为抵御病虫害的防御物质，这些生物碱会影响根际微生物群落结构，且在土壤中持久存在会带来潜在生态风险，但此前参与其降解的微生物和代谢途径尚未被阐明。本研究从大麦根际土壤中成功分离得到两株特异性降解菌：革兰氏阴性假单胞菌NyZ201（能以大麦芽碱为唯一碳、氮、能源生长，倍增时间2.5 h）和革兰氏阳性节杆菌NyZ202（能以芦竹碱为唯一碳、氮、能源生长，倍增时间3.8 h）。
贝莱泽芽孢杆菌YJ0-1胞外抑制产物的分离纯化及发酵培养基优化
大豆是全球重要的经济作物，核盘菌引起的大豆菌核病严重威胁其产量和品质，传统化学防治面临环境污染、病原菌抗药性等问题。本研究从中国东北落叶松根际土壤中分离得到的贝莱泽芽孢杆菌YJ0-1对核盘菌具有显著拮抗作用，其发酵液酸沉淀粗提物表现出强抗真菌活性。
Lrp/AsnC家族转录调控因子Lrp对于稻迪基氏菌的致病性至关重要
稻迪基氏菌可引起多种重要作物的严重软腐病，为解析其复杂的致病机制，本研究通过转座子诱变筛选关键毒力调控因子，在稻迪基氏菌EC1菌株中鉴定到一个Lrp/AsnC家族转录调控因子，命名为Lrp。表型分析表明，Lrp正调控生物膜形成以及泽胺类毒素（zeamines）、蛋白酶和多聚半乳糖醛酸酶的产生，负调控细菌游泳运动。缺失lrp基因导致细菌毒力显著衰减，证明Lrp是调控稻迪基氏菌致病性的关键因子。
系统发育宿主范围指数揭示噬菌体专化与毒力的生态限制
噬菌体通常被认为宿主范围有限，仅能感染特定细菌种内的菌株，但准确量化其特异性仍面临巨大挑战。传统宿主范围分析方法往往忽略宿主细菌的遗传多样性和种群动态，而这些因素可能深刻影响噬菌体的专化进化与毒力演化。本研究以遗传多样性极高的植物青枯病病原菌青枯雷尔氏菌复合种（RSSC）为模式系统，利用来自西南印度洋留尼汪岛和毛里求斯的23株遗传多样性噬菌体，开发了全新的宿主范围分析方法并验证了噬菌体生态学与进化的核心假说。