功能性小RNA互作组解析万古霉素耐受金黄色葡萄球菌中万古霉素应答sRNA RsaOI的作用靶点
耐万古霉素金黄色葡萄球菌（VISA）会造成万古霉素临床治疗失败，小RNA（sRNA）调控细菌耐药，但绝大多数sRNA-mRNA互作的生物学功能尚不明确。本研究以VISA菌株JKD6008为研究对象，采用RNase III-CLASH捕获体内RNA互作网络，整合RNA-seq转录组、Ribo-seq核糖体图谱、LC-MS/MS蛋白质组多组学数据，借助自组织映射（SOM）机器学习算法对基因聚类，筛选出转录丰度高但蛋白表达偏低、存在翻译抑制的基因集群。
改变PBP4与GdpP功能协同介导金黄色葡萄球菌产生类MRSA高水平广谱β-内酰胺耐药
mecA/mecC基因编码PBP2a是金黄色葡萄球菌高水平广谱β-内酰胺耐药（MRSA）经典机制，但越来越多无mec基因的MRLM菌株同样表现耐甲氧西林表型，其耐药机制尚不明确。本研究结合基因敲除、回补、MIC测定、种群生长实验、Bioscreen全自动生长曲线检测、细胞壁组分分析、线虫体内感染模型开展验证。
负载组氨酸激酶抑制肽的第五代聚酰胺胺树状大分子对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的群体感应抑制活性
耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）是医院与社区高发多重耐药致病菌，群体感应agr系统调控毒素、生物膜等毒力因子，靶向群体感应是低耐药抗感染新思路。本研究以末端甲氧吡咯烷修饰第五代PAMAM（G5）树状大分子负载群体淬灭肽QQ3，制备G5-QQ3纳米复合物；采用Bioscreen C全自动微生物浊度仪测定浮游菌生长曲线与MIC50，结合溶血实验、结晶紫生物膜定量、共聚焦活死染色、扫描电镜、RAW264.7巨噬细胞毒性实验开展活性评价。
基于结构虚拟筛选与生物学验证发现可恢复耐碳青霉烯鲍曼不动杆菌碳青霉烯敏感性的新型BfmR抑制剂
耐碳青霉烯鲍曼不动杆菌（CRAB）临床耐药问题严峻，BfmR是调控细菌毒力、抗生素耐药的双组分响应调控蛋白，是新型抗感染理想靶点。本研究以BfmR蛋白晶体结构为基础，搭建分层虚拟筛选流程，结合分子对接、分子动力学、MM/GBSA结合自由能计算筛选Specs化合物库，得到3个活性先导分子Cmp-86、Cmp-97、Cmp-98。体外实验证实三者均可降低美罗培南对CRAB菌株ZJ06的MIC；其中Cmp-98作用与BfmR敲除株效果相近，可下调K荚膜合成基因。
利用非洲大蜗牛壳简易合成并表征壳聚糖纳米颗粒，作为抗微生物耐药的潜在方案
全球抗生素耐药危机日益严峻，亟需天然可降解抗菌新材料。本研究以废弃非洲大蜗牛壳为原料，经脱蛋白、脱矿、脱乙酰等多步化学处理制备壳聚糖纳米颗粒；采用FTIR、XRD、SEM、TEM、EDXRF、EDS完成理化结构表征，利用芬兰Bioscreen C全自动微生物浊度仪测定最小抑菌浓度，同时琼脂扩散法测定抑菌圈，以左氧氟沙星作为阳性对照，测试菌株包括β-溶血性金黄色葡萄球菌、表皮葡萄球菌、大肠杆菌O157、肺炎克雷伯菌、伤寒沙门氏菌。
Pbp4为FtsW-PbpB肽聚糖合酶提供转肽酶活性以驱动粪肠球菌头孢菌素耐药
粪肠球菌天然对头孢菌素类抗生素存在固有耐药，分裂区肽聚糖合酶FtsW-PbpB是维持菌体分裂的核心复合物，但PbpB极易被头孢菌素酰化失活，该复合物如何在药物胁迫下持续合成细胞壁尚不明确。本研究以粪肠球菌OG1RF为模式菌株，构建pbpB、ftsW、pbp4诱导耗尽突变株，利用芬兰Bioscreen C全自动浊度仪测定生长曲线与头孢曲松MIC，结合差异干涉显微镜、体外糖基转移酶GTase活性实验、蛋白共纯化、微量热泳动MST互作检测等开展机制解析。
基于原子分散纳米酶的协同温和光热-纳米催化疗法用于清除多重耐药菌并促进感染创面愈合
多重耐药菌（MRSA）感染创面临床缺乏高效无耐药治疗手段，单一光热或纳米催化疗法抗菌效果有限。本研究通过MOF高温热解法制备氮掺杂碳纳米片负载铜锰双原子纳米酶（Cu/Mn-DSAzymes），该材料兼具类过氧化氢酶（CAT）、类氧化酶（OXD）双酶活性与近红外二区（NIR-II）光热性能；搭配96孔全自动微生物生长分析仪（Bioscreen C）记录大肠杆菌、MRSA生长曲线，结合材料理化表征、体外抗菌、细胞相容性、小鼠感染创面体内实验开展系统验证。
KPC过表达介导碳青霉烯耐药临床肺炎克雷伯菌产生头孢他啶-阿维巴坦异质性耐药
头孢他啶-阿维巴坦（CZA）是治疗产KPC碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌（CRKP）的核心复方药物，但临床菌株会出现CZA异质性耐药，常规药敏检测易误判为敏感，造成抗感染治疗失败，相关分子机制尚不明确。本研究收集2020-2022年国内3家三甲医院311株临床CRKP，通过种群图谱PAP筛选CZA异质性耐药菌株，结合微量肉汤稀释药敏、MLST分型、荚膜血清分型、全基因组测序、qRT-PCR基因拷贝与表达定量、反义RNA基因沉默、生长曲线检测、不同联用药物抑制实验开展系统探究。
携带多重耐药基因的泛耐药铜绿假单胞菌IncP-2A型质粒pMAS152特征及研究意义
多重耐药菌水平基因转移加剧全球抗菌药物耐药危机，质粒是耐药基因横向传播关键载体，解析耐药质粒特征与传播风险对感染防控至关重要。本研究以一株临床泛耐药铜绿假单胞菌MAS152为研究对象，结合药敏实验、接合转移试验、长短读长全基因组测序及生物信息分析，系统解析其携带的IncP-2A型大质粒pMAS152。
CroS胞外片段不参与信号感知，但可微调CroS信号强度以调控粪肠球菌头孢菌素耐药
粪肠球菌是临床重要条件致病菌，天然对头孢菌素类抗生素固有耐药，双组分调控系统CroS/R是介导该固有耐药的核心通路。CroS作为组氨酸激酶，感知头孢诱导细胞壁应激后发生自磷酸化，激活响应调节蛋白CroR，上调细胞壁合成相关基因表达产生耐药。
AMXT-1501靶向膜磷脂发挥抗革兰氏阳性与阴性多重耐药菌活性
多重耐药细菌感染给全球医疗体系带来巨大威胁，碳青霉烯耐药肠杆菌科（CRE）几乎对全部现有抗生素耐药，临床治疗手段极度匮乏。本研究从化合物文库筛选得到多胺转运抑制剂AMXT-1501，系统评估其体内外广谱抗菌、抗生物膜活性，并解析作用靶点与分子机制。体外药敏结果显示AMXT-1501对MRSA、产ESBL大肠杆菌、碳青霉烯耐药克雷伯菌、铜绿假单胞菌均具备良好抑菌活性，MIC50/MIC90范围3.13–12.5 μM；杀菌动力学实验证实其杀菌速度优于万古霉素、替加环素；亚抑制浓度下可抑制金黄色葡萄球菌、粪肠球菌生物膜形成，但无法清除成熟生物膜。
KDPG感应蛋白RccR调控铜绿假单胞菌碳代谢与氨基糖苷类抗生素耐受性
铜绿假单胞菌依靠复杂转录调控网络快速重塑细胞代谢，以此适应宿主微环境、产生抗生素耐受，但转录调控、碳代谢与氨基糖苷耐受三者的关联机制尚不清晰。本研究利用CRISPR/Cas12k转座子构建铜绿假单胞菌转录因子突变文库，筛选发现RpiR家族转录因子RccR（PA5438）是调控氨基糖苷耐受的关键基因；敲除rccR可显著提升菌株对妥布霉素、庆大霉素、阿米卡星耐受能力，对其他类别抗生素无影响。
牛至精油抑制变形链球菌生长及生物膜形成的作用机制
龋齿是全球高发生物膜介导感染性疾病，变形链球菌是核心致龋菌，其产酸、合成胞外多糖、形成生物膜是主要致毒因子，氯己定、氟化物等传统防龋试剂存在染色、味觉改变、诱导耐药等副作用。本研究以牛至精油（OEO）为研究对象，气相色谱质谱分析显示香芹酚为主要活性组分；采用芬兰FP-1100-C（Bioscreen系列全自动微生物生长分析仪）测定不同浓度OEO下变形链球菌完整生长曲线，结合平板活菌计数、结晶紫定量、共聚焦激光扫描电镜、透射电镜、胞外DNA荧光检测、细胞毒性实验系统探究抑菌与抗生物膜机制。
抗菌蓝光灭活铜绿假单胞菌：解析波长、生长阶段与培养基组分的多重影响
多重耐药铜绿假单胞菌是院内高发病原菌，常规抗生素治疗存在巨大局限，抗菌蓝光（aBL）是无耐药新型抗菌手段。本研究系统探究波长、细菌生长阶段、培养基金属组分三大关键因素对蓝光杀菌效率的调控规律。
全新设计短合成脂肽的抗菌活性与理化性质
多重耐药菌感染已成为全球医疗重大难题，传统抗生素副作用明显、耐药持续蔓延，新型人工合成抗菌肽是替代研究热点。本研究基于天然抗菌肽氨基酸分布规律从头设计3种六肽母链SHP-1.1、SHP-2.1、SHP-3.1，全部采用C端酰胺修饰提升稳定性；分别在N端连接棕榈酸(PAL)、石胆酸(LCA)得到两类脂肽衍生物。
抗生素胁迫下氨基糖苷耐药大肠杆菌适应度基因的全基因组筛选鉴定
氨基糖苷类抗生素耐药问题已严重威胁人畜健康，现有研究缺少耐药菌暴露于对应抗生素时细胞适应机制的系统解析。本研究以分别携带链霉素、庆大霉素、新霉素耐药质粒的大肠杆菌MG1655为材料，构建三套高密度Tn5转座子突变文库，利用转座子插入测序（TraDIS）技术，在亚抑菌浓度抗生素胁迫下筛选条件必需适应度基因。
双组分系统CiaRH调控外排泵SatAB及其与氟喹诺酮类药物耐药性的关联
猪链球菌是人畜共患病原菌，抗生素滥用导致该菌耐药问题日益严峻。细菌可通过双组分系统感知并响应抗生素压力。本研究证实双组分系统CiaRH参与调控猪链球菌对氟喹诺酮类药物的敏感性。ciaRH基因缺失菌株对氟喹诺酮类药物耐药性显著提升，菌株生长未受影响，胞内药物蓄积量降低。
适用于新型抗生素研发的基因型与表型多样化临床鲍曼不动杆菌菌株库
鲍曼不动杆菌是全球重点致病菌，其固有和获得性耐药问题突出，新型抗菌药物研发进展缓慢，给临床抗感染治疗带来巨大压力。目前该领域研究多依赖ATCC 17978、ATCC 19606、AB5075等模式菌株，这类菌株遗传与表型多样性有限，无法真实反映临床菌株特征。
耐药叠加效应：染色体耐药突变可抵消多重耐药临床质粒带来的适应性代价
质粒是细菌间抗生素耐药基因水平转移的主要载体，携带耐药质粒通常会给宿主细菌带来生长相关的适应性代价。而细菌染色体突变也可产生耐药性，同时改变菌体生理状态，但染色体耐药突变与耐药质粒之间的相互作用尚不明确。本研究将13株临床多重耐药质粒分别导入敏感型大肠杆菌，以及呋喃妥因、环丙沙星、链霉素三种染色体耐药突变菌株，在葡萄糖基础培养基中测定菌株指数生长速率。
利福平耐药相关rpoB突变可改变肽聚糖前体含量并影响细菌对β-内酰胺类药物的敏感性
该研究以枯草芽孢杆菌为模式菌，探究利福平（RIF）与头孢呋辛（CEF）联用压力下rpoB耐药决定区（RRDR）突变带来的多效影响。体外联合药敏进化实验筛选得到S487L、H482Y、Q469R三种关键rpoB突变：S487L突变同时赋予菌株利福平和头孢呋辛双重耐药；H482Y突变使菌株对头孢呋辛敏感性提升32倍；Q469R仅小幅提升头孢呋辛耐药性。