含二硫键的抗生素硫柳素的还原活化由杆菌硫醇及FAD依赖性二硫还原酶共同介导
金属离子对生命普遍必需，是代谢关键酶的必要组成。金属酶依赖金属摄取与转运通路完成金属负载。许多微生物产生天然产物作为金属螯合剂，用于自身营养或作为抗菌物质。宿主免疫细胞会通过螯合金属离子限制细菌生长，即营养免疫。细胞通过激活通路应对金属缺乏，优先将金属输送至最关键的酶。
105位甘氨酸导致A类β-内酰胺酶对克拉维酸和阿维巴坦产生耐药性
本研究针对A类β-内酰胺酶Ambler 105位“看门”残基展开饱和突变与深度测序 fitness 分析，覆盖BlaC、CTX-M-14、KPC-2、NmcA、TEM-1五种酶。结果显示，105位突变为甘氨酸（Gly）或精氨酸（Arg）可显著降低对克拉维酸与阿维巴坦的敏感性。BlaC I105R突变可提升羧苄西林活性并逃逸抑制剂作用；CTX-M-14与TEM-1的Y105G突变显著降低对阿维巴坦的敏感度，源于活性位点构象柔性增加。该位点是临床耐药突变热点，可为新型β-内酰胺酶抑制剂设计提供依据。
芬戈莫德作为强效抗金黄色葡萄球菌药物：pH依赖性细胞包膜损伤及生物膜/持久菌的根除
本研究对已获批用于多发性硬化症的药物芬戈莫德进行抗菌老药新用探究，证实其对金黄色葡萄球菌（包括MRSA）、粪肠球菌、无乳链球菌等多种革兰氏阳性菌具有强效杀菌活性，可显著清除持久菌、抑制生物膜形成并根除成熟生物膜。其杀菌机制为pH依赖性破坏细菌细胞膜通透性与细胞包膜完整性，外源性添加心磷脂、磷脂酰乙醇胺可剂量依赖性拮抗其抗菌活性。
噬菌体Kpph1和Kpph9针对高致病性碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌的特性鉴定与基因组学研究
本研究分离鉴定两株靶向K2血清型高毒力碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌的裂解噬菌体Kpph1与Kpph9，系统分析其形态学、宿主谱、一步生长曲线、稳定性、杀菌与抗生物膜活性，并开展全基因组测序与比较基因组分析。两株噬菌体均具有宽pH（4–11）与温度（≤50℃）耐受性，能高效抑制细菌生长、阻断生物膜形成并降解成熟生物膜。
单点核糖体突变体向多氨基糖苷类抗性进化的特异性
本研究以大肠杆菌rpsL基因编码的核糖体蛋白S12上不同链霉素抗性单点突变体为模型，探究其对阿米卡星、庆大霉素、卡那霉素、妥布霉素四种2-脱氧链霉胺类氨基糖苷类抗生素的后续抗性进化能力。结果显示不同单点突变表现出显著差异的可进化性，多数符合适应性下降规律，即初始抗性水平越高，有效有益突变率越高但效应量越小；部分基因型则完全无法产生次级抗性，成为进化死点。
霍氏肠杆菌通过孔蛋白缺失将毒力替换为碳青霉烯耐药性
本研究以临床流行的霍氏肠杆菌ST78与ST171克隆株为对象，利用小鼠腹膜炎模型与比较基因组学，鉴定出OmpC与OmpD两种孔蛋白是免疫健全宿主中毒力必需因子。这两种孔蛋白可介导碳青霉烯类抗生素进入菌体，其缺失会导致菌株对碳青霉烯类耐药。基因组分析显示临床菌株中孔蛋白基因常发生突变，提示抗生素治疗带来选择压力。
ssDNA噬菌体FLiP以dsDNA形式存在于耐药黄杆菌宿主中
本研究以黄杆菌属及其单链DNA噬菌体FLiP为模型，探究宿主对噬菌体的抗性机制。结果显示，在无噬菌体条件下，耐药菌株与原始菌株生长无显著差异，说明对FLiP的抗性不产生可检测的适应度代价。基因组分析未发现统一的抗性突变或抗噬菌体系统，但在耐药菌株B114r中，FLiP基因组以环状游离双链DNA形式存在，提示可能存在溶源性或假溶源性。
RNA聚合酶突变通过防止氨基酸和核苷酸代谢失调赋予对β内酰胺的抗性
RNA聚合酶（RNAP）突变可导致细菌对多种抗生素产生抗性，但其分子机制尚不明确。本研究以枯草芽孢杆菌为模型，对比两种RNAP突变：rpoC G1122D（β'亚基）增强头孢呋辛抗性，rpoB H482Y（β亚基）增加敏感性。研究发现，β内酰胺抗性通过抑制支链氨基酸、甲硫氨酸与嘧啶合成通路实现，这些通路在药物处理会上调并引发活性氧产生，增强药物敏感性。
解码SCFA-CpxAR-OMP轴作为防范抗菌药物耐药性在肠道-环境界面传递的饮食检查点
本研究发现肠道菌群代谢物短链脂肪酸（SCFAs）可强效抑制抗生素耐药基因（ARGs）的水平转移。高纤维饮食可重塑肠道菌群，使SCFAs产量提升1.6倍，体内ARGs传播率最高降低5.8倍。机制上，SCFAs通过CpxAR双组分系统下调外膜蛋白（OMPs）表达，破坏接合转移相关启动子trfAp与trbBp活性，从而阻断质粒接合转移。该研究揭示了SCFA-CpxAR-OMP调控轴，提出膳食纤维干预可作为阻断“肠道-环境”耐药传播循环的可行策略。
MexR和NalD是铜绿假单胞菌外排泵MexAB-OprM的脓青素响应性转录抑制因子
脓青素（PYO）可通过诱导RND型外排系统表达增强铜绿假单胞菌耐药性，但MexAB-OprM从抑制到上调的初始解阻遏机制尚不明确。本研究发现MexR和NalD可作为PYO受体直接结合PYO，使其从mexA启动子解离，解除对mexAB-oprM的抑制。通过结构模拟与突变实验鉴定了二者结合PYO的关键氨基酸残基。
DLFea4AMPGen：融合深度学习模型特征的抗菌肽从头设计
深度学习在抗菌肽设计中潜力巨大，但现有方法存在筛选成功率低、虚拟序列库规模过大等问题。本文提出DLFea4AMPGen策略，通过深度学习提取抗菌、抗真菌、抗氧化相关关键特征，利用SHAP方法量化氨基酸贡献，提取关键特征片段并分为四个亚家族，构建合理序列空间并从头设计16条候选肽。
基于6-溴吲哚和6-溴吲唑、含3-氨基噻吩-2-羧酸结构的细菌胱硫醚γ-裂解酶抑制剂
本研究设计合成5种新型6-溴吲哚/6-溴吲唑类衍生物（MNS2–MNS6），作为细菌胱硫醚γ-裂解酶（CGL）抑制剂与抗生素增效剂。以6-溴吲哚、6-溴吲唑与噻吩/呋喃杂环为骨架构建化合物，体外评价其对庆大霉素、卡那霉素的抗菌增效作用与H₂S生成抑制效果。
EPS抑制剂处理沙门氏菌影响进化但不筛选出对生物膜抑制产生抗性的菌株
本研究以鼠伤寒沙门氏菌为对象，长期使用2‑氨基咪唑类EPS抑制剂RC41处理生物膜，结果显示细菌未对生物膜抑制作用产生抗性，但会通过突变外排泵调控基因ramR与RNA聚合酶相关基因rpoS/rpoC来适应抑制剂带来的生长延迟副作用，进而提升外排活性并降低生物膜形成能力。
黄芩苷联合苯唑西林钠对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的协同抗菌活性
本研究探究黄芩苷与苯唑西林钠联用对MRSA USA300的协同抗菌作用。单独使用时二者抗菌效果均较弱，联合使用后分级抑菌浓度指数FICI为0.5，呈现显著协同效应。机制上，黄芩苷可增加细菌细胞壁与细胞膜通透性，促进苯唑西林钠进入菌体发挥杀菌作用；二者联用还可通过减少胞间多糖黏附素PIA生成，显著抑制MRSA生物膜形成。该组合为临床治疗MRSA耐药感染提供新策略。
季鏻盐型小分子抗菌材料对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的抗菌活性
本研究合成五种不同烷基链长度的季鏻盐小分子抗菌剂，评估其对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）的抗菌与抗生物膜活性。结果表明，抗菌效果随烷基链延长显著提升，其中正戊基三苯基碘化鏻（[PTPP]·I）活性最优，对MRSA的最低抑菌浓度为16 μg/mL，可在36小时内持续抑制细菌生长。
磁性微纤维高热疗法协同抗耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的抗菌活性
本研究构建负载超顺磁性氧化铁纳米颗粒（SPIONs）的磁性微纤维，在交变磁场下实现局部高热，与多西环素联用对抗耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）。通过火焰喷雾热解合成锰掺杂磁性纳米颗粒，静电纺丝制备聚甲基丙烯酸甲酯微纤维并优化力学与发热性能。
通过结晶紫染色法评估负载阿托伐他汀的纳米结构脂质载体的抗菌潜力与生物膜抑制能力
本研究将降脂药阿托伐他汀（ATR）封装于纳米结构脂质载体（NLC），旨在提升其水溶性与抗菌、抗生物膜效果。采用高压均质与超声法制备ATR-NLC，对粒径、电位、包封率、体外释放进行表征；以金黄色葡萄球菌、耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）、大肠杆菌为模型，检测其抗菌活性与生物膜抑制作用。
细菌脂钙蛋白捕获抗生素揭示了固有抗生素耐药性的胞外作用机制
当前抗生素作用与耐药性研究多聚焦于细菌胞内的核心功能靶点，而微生物在抗生素接触菌体前将其灭活的胞外耐药机制仍鲜有探索。本研究发现，洋葱伯克霍尔德菌在亚致死浓度抗生素暴露下，会分泌一种可溶性细菌脂钙蛋白（BCNs），该蛋白可在体外和体内提升细菌对多种类别抗生素的耐药性；在洋葱伯克霍尔德菌ΔbcnA突变株中异源表达铜绿假单胞菌、结核分枝杆菌、耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的脂钙蛋白同源基因，均可复现该耐药表型。
同源碳青霉烯耐药高毒力肺炎克雷伯菌菌株的毒力多态性机制
碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌（CRKP）因高病死率和强传播性已成为全球重大公共卫生问题，其通过获得携带耐药和毒力基因的质粒可进化为碳青霉烯耐药高毒力肺炎克雷伯菌（CR-hvKP），但目前对同时携带耐药和毒力基因的质粒进化机制仍缺乏系统研究。
糖磷酸介导的肽聚糖前体合成抑制
抗生素耐受性是致病菌在常规杀菌抗生素作用下长期存活并向耐药性发展的关键中间阶段，革兰氏阴性致病菌霍乱弧菌对β-内酰胺类抗生素具有高度耐受性。本团队前期研究发现，敲除糖酵解关键酶编码基因pgi（葡萄糖-6-磷酸异构酶）会导致霍乱弧菌细胞壁损伤并显著增加其对β-内酰胺类抗生素的敏感性，本研究进一步揭示了该损伤的分子机制。