实验共演化显示假茄科雷尔氏菌PhcA促进丝状噬菌体RSCq的感染
与研究较为充分的裂解性噬菌体-细菌互作相比，细菌与丝状噬菌体的相互作用（尤其是在病原菌致病背景下）仍存在大量认知空白。本研究以植物青枯病病原菌假茄科雷尔氏菌和丝状噬菌体RSCq为研究对象，探究二者的共进化动态。实验共进化结果揭示了全局毒力调控因子PhcA在丝状噬菌体感染中的关键作用，且其对噬菌体成功感染的调控不依赖于丝状噬菌体的经典受体IV型菌毛。
贝莱泽氏杆菌的LXG毒素以T7SS依赖的方式介导接触依赖性抑制以增强根际适应性
根际细菌为争夺生态位会采用多种策略抑制竞争对手，接触依赖性抑制（CDI）是其中一种通过分泌系统直接向邻近细菌递送毒性蛋白的重要机制，但其在自然环境中的生态功能仍不明确。本研究以植物根际促生菌贝莱斯芽孢杆菌SQR9为对象，发现其基因组编码7对LXG结构域毒素-抗毒素系统，能够在生物膜中介导对其他芽孢杆菌菌株的接触依赖性抑制。
1,3,4-噻二唑衍生物与两性霉素B协同组合物抗真菌潜力的高级光谱学与理论研究及评估
本研究对新型1,3,4-噻二唑衍生物2,4-二羟基-N-(5-甲基-1,3,4-噻二唑-2-基)苯并硫代酰胺（TBTA）与抗真菌“金标准”两性霉素B（AmB）的协同组合物进行了系统的光谱学、量子化学理论计算和微生物学研究。通过电子吸收/荧光光谱、共振光散射（RLS）、圆二色谱（CD）、动态光散射（DLS）、荧光各向异性及时间相关单光子计数（TCSPC）荧光寿命测定等多种技术，在DMSO和PBS介质中分析了TBTA对AmB聚集状态的影响。
有机肥增强番茄根部微小RNA的分泌以促进有益根际微生物扩张并抑制青枯雷尔氏菌增殖
抑病土壤的根际微生物组、植物根系分泌物及病原菌抑制是植物根际免疫的核心要素，“呼救”机制被用于描述这一免疫响应过程，但目前对植物调控根际微生物功能基因的机制仍存在认知空白，多数研究仅证实根系分泌物介导了“呼救”过程。真核生物与原核生物通过微小RNA（miRNA）的跨界互作为宿主-微生物互作研究提供了新方向。
一种微需氧诱导的小热休克蛋白促进豌豆根瘤菌与豌豆的共生并与多种类菌体蛋白相互作用
根瘤菌与豆科植物建立共生关系的过程中，会面临根瘤内多种不利的物理和化学微环境，需要进化出相应的适应机制。前期蛋白质组学研究发现，豌豆根瘤菌（*Rhizobium leguminosarum* bv. viciae, Rlv）UPM791的小热休克蛋白（sHSPs）在不同宿主的类菌体中存在差异表达。本研究对宿主特异性表达的sHSP RLV_1399进行了功能分析，发现rlv_1399缺失突变体与豌豆的共生性能显著下降，但对小扁豆无明显影响。
两种锌ABC转运蛋白促进豌豆根瘤菌与豌豆和小扁豆的共生关系
根瘤菌-豆科植物共生关系的建立需要双方适应根瘤内的金属离子环境，许多根瘤菌金属酶对类菌体功能和共生性能至关重要。前期蛋白质组学分析发现，豌豆根瘤菌（*Rhizobium leguminosarum* bv. viciae, Rlv）UPM791在豌豆类菌体中高表达一个ABC转运系统的金属结合蛋白RLV_3444，提示豌豆共生体系中类菌体的锌供应更受限制。
巨型芽孢杆菌GXU087分泌吲哚-3-乳酸促进大豆生长和结瘤
芽孢杆菌属细菌是公认的植物促生细菌（PGPB），但其促进作物生长的具体机制仍不明确。本研究旨在探究巨型芽孢杆菌GXU087对大豆的促生效应及其作用机制。体外实验表明，GXU087具有溶磷、固氮、产胞外多糖和生物膜形成等多种PGP性状。盆栽实验显示，GXU087单接种显著提升大豆鲜重，与日本缓根瘤菌USDA110共接种时对生长和结瘤具有协同促进作用。
合成芽孢杆菌群落中的细菌社会互动促进植物生长
植物促生根际细菌（PGPR）是提升作物产量的可持续手段，合成微生物群落已成为工程化根际微生物组的有力工具，但由于对细菌社会互动的理解不足，设计功能稳定的群落仍面临挑战。本研究以商业化重要PGPR菌株贝勒泽氏芽孢杆菌SQR9为对象，探究其对根际群落尤其是芽孢杆菌属内社会互动的影响。
贝勒泽氏芽孢杆菌20507通过分泌黄酮类物质促进日本缓根瘤菌USDA110与大豆的共生关系
根瘤菌与植物促生根际细菌（PGPR）共接种可提升大豆生长和结瘤效率，但不同氮供应水平（0–10 mmol/L）下贝勒泽氏芽孢杆菌20507与日本缓根瘤菌USDA110的互作机制尚不明确。本研究设置4个氮水平梯度，对大豆进行单菌和双菌共接种处理，测定了结瘤、生长、生理及氮含量指标；对缺氮条件下的大豆根系进行转录组测序，通过质谱鉴定贝勒泽氏芽孢杆菌发酵液中的黄酮类物质，并验证芦丁对根瘤菌结瘤基因NodD1/NodD2的调控作用。
植物根际菌的实验进化揭示了新兴的适应性突变
植物促生根际细菌（PGPR）在根际的定殖能力是其发挥促生和生防作用的核心基础，但PGPR在根际复杂环境中的进化过程和适应潜力仍未被系统研究。本研究以分离自小麦全蚀病抑病土的毕节假单胞菌2P24（原名荧光假单胞菌2P24）为模式菌株，建立了无菌小麦根际连续传代实验进化系统，模拟其自然进化过程并实时追踪基因组变异。
SinI和SinR在贝勒泽氏芽孢杆菌与枯草芽孢杆菌的生物膜形成、根际定殖及生物防治效能方面功能存在差
枯草芽孢杆菌和贝勒泽氏芽孢杆菌常作为植物病害生防菌，其生防能力依赖生物膜形成实现根际定殖。在枯草芽孢杆菌中，SinI正向调控生物膜形成、根际定殖和生防效能，SinR则起负向作用。为提升贝勒泽氏芽孢杆菌R9对烟草青枯病的生防效果，研究分别敲除了该菌株的sinI和sinR基因。
丁香假单胞菌番茄致病变种DC3000中五种Rsm蛋白的表达、调控及生理功能
RsmA/CsrA家族是一类在革兰氏阴性菌和部分革兰氏阳性菌中发挥关键转录后调控作用的小RNA结合蛋白。多数已研究的细菌仅含一个RsmA/CsrA基因，但丁香假单胞菌番茄致病变种（Pto）DC3000基因组编码五个Rsm蛋白：RsmA/CsrA2、RsmC/CsrA1、RsmD/CsrA4、RsmE/CsrA3和RsmH/CsrA5。
玉米迪基氏菌EC1中c-di-GMP信号传导机制与生物学功能的系统分析
玉米迪基氏菌（Dickeya zeae）是重要的侵袭性植物病原细菌，会给香蕉和水稻种植造成重大经济损失。前期研究发现，该菌EC1菌株中负责c-di-GMP合成与降解的信号蛋白（环化酶/磷酸二酯酶），在细菌从固着到运动的表型转换中发挥重要作用。
新型裂解性噬菌体对植物病原黄单胞菌生物防治的比较分析
黄单胞菌属是一类重要的植物病原细菌，可侵染400余种植物，引发多种农作物的毁灭性病害，造成严重的经济损失，其中多个种被列为检疫性有害生物。目前针对黄单胞菌病害的传统防治手段存在铜制剂环境污染、抗生素诱导细菌耐药性等诸多问题，亟需开发创新的绿色防控工具，而细菌病毒（噬菌体）是极具潜力的生物防治手段。
dctA、dctB与dctD基因参与西瓜嗜酸菌对C4-二羧酸、碳源、氮源的利用及致病性调控
西瓜细菌性果斑病（BFB）是由西瓜嗜酸菌（*Acidovorax citrulli*）引起的葫芦科作物毁灭性细菌性病害，而碳源的吸收利用是细菌成功定殖宿主植物的核心基础。C4-二羧酸是细菌关键的碳源与能源物质，其转运由C4-二羧酸转运系统（Dct）完成，该系统在细菌基础代谢中发挥重要作用，但dct基因在西瓜嗜酸菌中的功能尚未明确。
全球性植物病原细菌对乙酰胆碱的趋化作用
聚焦全球重要植物病原细菌对植物源信号分子乙酰胆碱的趋化机制与生物学功能展开系统研究。乙酰胆碱作为哺乳动物经典神经递质，同时也是调控植物生长发育与抗逆性的信号分子，但其在植物 - 病原细菌互作中的作用尚未明确。
片球菌素 PA-1 与 L - 乳酸对嗜水气单胞菌的协同抑制机制
片球菌素 PA-1（PA-1）是乳酸菌产生的一类膜靶向细菌素，对多种革兰氏阳性致病菌具有抗菌活性，但革兰氏阴性菌的外膜会阻止其接触作用靶点。本研究解析了 PA-1 与 L - 乳酸对水产养殖及食品领域重要的革兰氏阴性致病菌嗜水气单胞菌（Aeromonas hydrophila）的协同抑制机制。
生长素介导的根际细菌普城沙雷氏菌（Serratia plymuthica）对有毒代谢物的敏感性、环二
植物与其微生物群之间的信息交流高度动态，涉及复杂的信号分子网络。其中，生长素吲哚 - 3 - 乙酸（IAA）是关键的植物激素，不仅调控植物的生长发育，还逐渐成为重要的跨界和种内信号分子，调控细菌在与植物宿主互作过程中的多个关键生理过程，但其对应的信号级联机制仍尚不明确。本研究深入解析了 IAA 在植物共生细菌中发挥调控功能的未知分子机制，填补了相关领域的研究空白。
细菌生长素分解代谢是促进植物生长和根际定殖适应性的关键驱动因素
植物与其共生微生物之间的跨界信号交流，对植物的生长发育和环境适应至关重要。吲哚-3-乙酸（IAA）是植物体内最主要的生长素，调控植物生长发育全过程，同时也能调节细菌的生理与行为。IAA的生物学效应具有严格的浓度依赖性，维持生长素稳态对植物而言至关重要。尽管植物促生细菌产生的IAA通常能促进植物生长，但过量的IAA会对植物生理产生毒害作用。
递送CRISPR-AsCas12f1系统的 “特洛伊木马” 噬菌体防控青枯雷尔氏菌引发的植物青枯病
由青枯雷尔氏菌引发的植物青枯病会造成巨大的农业经济损失，因此亟需开发针对该病害的有效防控方法。丝状噬菌体不会裂解宿主细菌，对宿主细胞的代谢负担极小，为植物细菌病害的生物防治提供了潜在解决方案。