Global epidemiological and genetic characteristics of carbapenem-resistant Escherichia coli carrying blaIMP

携带blaIMP的碳青霉烯耐药大肠杆菌的全球流行病学与遗传特征

来源:Microbiology Spectrum 2026, Volume 14, Issue 1, e03244-25

《微生物学谱》,2026年,第14卷,第1期,文章编号e03244-25

 

摘要

本研究整合本地与全球监测数据,对携带blaIMP的碳青霉烯耐药大肠杆菌(CREC)开展全面分析。对中国浙江4家三甲医院2017-2024年收集的94株CREC中9株blaIMP-4阳性菌株进行全基因组测序、药敏、质粒接合、稳定性与适应度实验。这些菌株呈多重耐药,但对多黏菌素、替加环素、阿米卡星敏感,分属7种ST型,首次检出高风险克隆ST1193。菌株携带结构相似的IncN型blaIMP质粒,接合频率高、传代100代稳定且适应度代价极低。整合子、转座子、插入序列等可移动元件助力blaIMP水平转移。对全球340株blaIMP阳性CREC分析显示遗传多样性极高(82个ST型),ST131占绝对优势(36.18%),中国、日本、澳大利亚为主要流行国家,耐药基因与质粒复制子呈显著正相关。研究提示blaIMP-CREC风险持续上升,需持续基因组监测。

 

关键词

碳青霉烯耐药大肠杆菌;blaIMP;IncN质粒;全球流行病学;可移动遗传元件;ST131;ST1193;水平转移

 

研究目的

系统阐明携带blaIMP的碳青霉烯耐药大肠杆菌的表型特征、质粒传播特性、全球流行病学规律与遗传演化特征,明确其传播风险与防控重点。

 

研究思路

收集浙江地区9株blaIMP-4阳性CREC,进行药敏测定、全基因组测序与质粒分析;评估IncN质粒的接合能力、稳定性与适应度代价;整合NCBI全球340株blaIMP-CREC基因组数据,开展ST分型、系统发育、地理分布、耐药基因与毒力基因比较;分析质粒与耐药基因的相关性,揭示传播机制与流行规律。

 

研究亮点

1 首次在中国地区报道携带blaIMP-4的高风险克隆ST1193,填补区域流行病学空白。

2 证实IncN质粒具有高接合频率、高稳定性、低适应度代价,是blaIMP扩散的核心载体。

3 完成全球最大规模blaIMP-CREC基因组解析,揭示82种ST型的高度遗传多样性。

4 明确日本、澳大利亚、中国为主要流行国家,ST131为全球优势克隆。

5 证明耐药基因数量与质粒类型显著正相关,突出质粒在耐药传播中的核心作用。

 

可延伸的方向

1 持续监测临床blaIMP菌株尤其是ST1193与ST131克隆的流行趋势。

2 开发针对blaIMP与IncN质粒的快速分子检测方法。

3 探究IS26、整合子在blaIMP质粒重组与进化中的驱动机制。

4 评估新型药物对blaIMP阳性菌株的体外与体内疗效。

5 开展blaIMP在动物、环境、人类之间的One Health传播链研究。

 

测量的数据及研究意义

1 9株blaIMP-4阳性CREC对10种抗生素MIC数据(表1),明确多重耐药谱与有效治疗药物。

 

2 质粒接合频率数据,证明IncN质粒高效水平传播能力。

3 传代100代质粒稳定性数据,显示100%稳定,支持长期传播。

4 受体菌与接合子生长曲线、相对生长速率、曲线下面积AUC数据(图3),评估质粒适应度代价极低。

 

5 全球340株菌株ST分型与系统发育数据(图7),揭示ST131主导、7大进化分支。

 

6 全球地理分布与时间演变数据(图5),明确流行国家、优势亚型(IMP-4/6/1)与传播趋势。

 

7 耐药基因、毒力基因、质粒类型的PCoA与相关性数据(图6、8),证实质粒驱动耐药传播。

 

 

 

结论

1 中国浙江地区blaIMP-4-CREC呈多重耐药,仅对多黏菌素、替加环素、阿米卡星敏感。

2 高转移、高稳定、低适应代价的IncN质粒是blaIMP在大肠杆菌中扩散的关键载体。

3 全球blaIMP-CREC遗传多样性极高,ST131为优势克隆,ST1193为新兴高风险克隆。

4 日本、澳大利亚、中国为主要流行国家,IMP-4、IMP-6、IMP-1为主要亚型。

5 可移动元件(整合子、IS26、转座子)与质粒共同推动blaIMP的水平转移与进化。

6 需加强blaIMP-CREC的全球基因组监测与感染控制,遏制传播。

 

使用芬兰Bioscreen仪器测量数据的研究意义

使用Bioscreen C分析仪在37℃连续振荡培养20小时,每5分钟自动读取OD600,精准绘制受体大肠杆菌J53与接合子J53/pIMP-CREC3006的生长曲线;精确计算相对生长速率与生长曲线下面积AUC,客观证明IncN质粒仅带来极轻微适应度代价,解释该质粒能在无抗生素压力下稳定维持并广泛传播的核心原因,为评估质粒传播风险提供标准化、高通量、无偏差的定量依据。