Isolation and characterization of fMGyn-Pae01, a phiKZ-like jumbo phage infecting Pseudomonas aeruginosa

fMGyn-Pae01的分离与特性分析,一种感染铜绿假单胞菌的phiKZ样巨型噬菌体

来源:Virology Journal 2025, Volume 22, Article number 55

《病毒学杂志》,2025年,第22卷,文章编号55

 

摘要

本研究从商用噬菌体鸡尾酒中分离出一株感染铜绿假单胞菌的phiKZ样巨型噬菌体fMGyn-Pae01。该噬菌体为裂解性,基因组大小277.8 kb,不含溶原、毒力或耐药相关基因,符合噬菌体治疗安全要求。宿主谱检测显示其对铜绿假单胞菌具有广谱侵染性,且不依赖O血清型。通过对噬菌体抗性突变株的全基因组测序、运动性实验与吸附实验证实,该噬菌体以细菌鞭毛为吸附受体。fMGyn-Pae01无法抑制铜绿假单胞菌生物膜形成,单独使用时在生物膜相关感染中治疗潜力有限。该研究明确了新型巨型噬菌体的生物学特性与受体识别机制,为铜绿假单胞菌噬菌体治疗提供新资源。

 

关键词

铜绿假单胞菌;巨型噬菌体;phiKZ样噬菌体;fMGyn-Pae01;鞭毛受体;宿主谱;噬菌体治疗;生物膜

 

研究目的

分离鉴定针对多重耐药铜绿假单胞菌的新型巨型噬菌体,明确其形态、基因组、宿主谱、吸附受体及对生物膜的影响,评估其噬菌体治疗应用潜力。

 

研究思路

从商用噬菌体鸡尾酒中分离纯化噬菌体fMGyn-Pae01;通过电镜观察形态,测序解析基因组特征;利用液体培养法测定142株细菌的宿主谱;筛选抗性突变株并全基因组测序定位受体基因;结合运动性与吸附实验验证受体;检测噬菌体对生物膜形成的影响。

 

研究亮点

1 分离到一株安全型phiKZ样巨型裂解噬菌体,无耐药与毒力基因,适合临床应用。

2 首次明确该类噬菌体以鞭毛为吸附受体,修正了部分同类噬菌体以IV型菌毛为受体的认知。

3 宿主谱广谱且不依赖O血清型,具有良好的泛用性。

4 建立“抗性突变-测序-功能验证”的高效受体鉴定流程。

 

可延伸的方向

1 将fMGyn-Pae01与解聚酶噬菌体联用,实现杀菌与清除生物膜双重效果。

2 探究鞭毛缺陷型抗性突变株的毒力变化,评估治疗安全性。

3 优化噬菌体鸡尾酒配方,扩大宿主范围并延缓抗性产生。

4 解析尾部纤维蛋白与鞭毛结合的分子机制,指导噬菌体改造。

5 开展动物模型实验评价体内抗感染效果。

 

测量的数据及研究意义

1 噬菌体电镜形态与尺寸数据(图1、表1),确定为肌尾噬菌体科巨型噬菌体。

 

 

2 基因组基本特征数据,证实基因组277.8 kb,无有害基因,安全性高。

3 142株菌株宿主谱OD600抑制数据,证明广谱侵染铜绿假单胞菌且不依赖O抗原。

4 抗性突变株SNP/InDel数据(表2),锁定flgK、rpoN、fliC、fliE等鞭毛合成基因。

 

5 突变株运动能力数据(图4),证实突变株丧失运动能力,鞭毛结构异常。

 

6 噬菌体吸附效率数据(图5),证明抗性株无法吸附,确定鞭毛为受体。

 

7 生物膜结晶紫定量数据(图6),表明该噬菌体无抗生物膜活性。

 

 

结论

1 成功分离鉴定裂解性phiKZ样巨型噬菌体fMGyn-Pae01,基因组安全无致病风险。

2 该噬菌体对铜绿假单胞菌具有广谱宿主范围,侵染不依赖脂多糖O血清型。

3 fMGyn-Pae01以铜绿假单胞菌鞭毛作为特异性吸附受体。

4 该噬菌体不具备降解或抑制铜绿假单胞菌生物膜的能力。

5 作为安全广谱的裂解噬菌体,适合与抗生物膜制剂联合用于噬菌体治疗。

 

使用芬兰Bioscreen仪器测量数据的研究意义

使用Bioscreen C分析仪在Honeycomb2板中37℃连续培养10小时,自动监测OD600值,高通量定量噬菌体对142株细菌的生长抑制效率;以50%、70%抑制率为标准,客观划分高效感染、低效感染与不感染,排除人工读数误差,为宿主谱判定提供标准化、可重复的定量依据,是噬菌体宿主范围筛选的核心可靠数据。