1.2.3菌落PCR鉴定


以菌落为模板,采用2×Phanta®Max Master Mix(Dye Plus)酶进行菌落PCR鉴定。反应体系为:灭菌蒸馏水8.5 mL,2×Phanta®Max 12.5 mL,菌液模板2.0 mL,上下游引物各1.0 mL,共25.0 mL。反应条件为:94℃2 min;94℃30 s,55℃30 s,72℃50 s,30个循环。


1.2.4病毒拯救

在转染前1 d,将铺满单层90%以上的BHK-21细胞铺于6孔细胞培养板中,将菌落PCR鉴定正确的SVA重组质粒通过脂质体Lipofectamine 3000按照试剂盒建议的试验方案进行转染,同时转染EGFP N2质粒观察转染效率,置于37℃含5%CO2的培养箱中培养,48 h后观察转染效率;成功转染的细胞反复冻融3次,8 000 r/min离心5 min收获上清,将上清重新接种于新的BHK-21细胞,盲传3代(F3),观察细胞病变情况,收集发生病变的细胞毒。


1.2.5拯救病毒鉴定


将拯救的病毒传至第5代(F5),收获病毒培养液,通过天隆DNA/RNA磁珠法全自动核酸提取试剂盒,采用HiScript®III RT SuperMix for qPCR(+gDNA wiper)进行反转录,同时清除DNA以排除转染质粒对测序结果的干扰。依据2017年广东SVA全基因序列(登录号:MG428683.1),设计7对引物(表2),能够扩增出部分重叠、覆盖SVA全基因组序列的7条片段。以cDNA为模板,进行PCR扩增。反应体系为:灭菌蒸馏水19 mL,2×Phanta®Max 25 mL,cDNA模板2 mL,上下游引物各2 mL,共50 mL。反应条件为:94℃2 min;94℃30 s,55℃30 s,72℃50 s,30个循环。PCR产物进行琼脂糖凝胶电泳,电泳阳性条带切胶后送生工生物技术公司测序。

表2拯救病毒鉴定用引物序列


1.2.6生长曲线分析


将传至第5代的拯救毒株与亲本毒株(MOI=0.1)分别接种铺满单层BHK-21细胞的96孔板中,每种毒株3次重复,吸附1 h,PBS洗涤2次,加入含2%胎牛血清的培养液继续培养。在接种后6、12、18、24 h分别收获病毒,测定不同时间点病毒TCID50,绘制病毒生长曲线,比较拯救毒株与亲本毒株的增殖特性。


1.2.7间接免疫荧光试验


在12孔板中接种BHK-21细胞,待细胞生长至90%,分别接种rSVA与亲本毒株(MOI=0.1),同时设置阴性对照;接毒18 h后,以4%冰冷多聚甲醛固定细胞10 min;PBS洗涤3次后用5%BSA溶液封闭,孵育特异性SVA一抗(针对VP2蛋白),PBS洗涤后孵育FITC标记的二抗,在荧光显微镜下观察结果。


1.2.8噬斑形成试验


将拯救毒株与亲本毒株样品连续10倍稀释后分别接种BHK-21细胞,放置于37℃5%CO2培养箱中感染1 h;弃去病毒液,用PBS洗涤细胞2~3次;将低熔点琼脂糖与2×DMEM(体积比为1:1)混合后以2 mL/孔加入6孔板中,继续培养2~3 d;在显微镜下观察,当产生明显噬斑后用4%甲醛溶液固定细胞3 h,每孔加入0.5 mL 1%结晶紫室温染色0.5 h;水洗去染色液,进行噬斑形态观察。


2结果


2.1 SVA感染性克隆构建策略


SVA基因组全长较短,仅7.3 kb,可采用高保真酶一步法扩增。同时几个基因元件扩增引物设计好同源臂,使pWSK-29载体5'端到3'端依次重组进CMV、SVA全基因组、poly(A)+HDVr(图1)。

图1 pWSK-29-SVA感染性克隆示意图


2.2 SVA全基因组及相关基因片段PCR扩增


如图2所示:以SVA-GXT91 RNA为模板扩增出长度约为7.3 kb的SVA病毒基因片段;以引物为模板,通过退火自结合方式扩增出了poly(A)+HDVr;以EGFP N2质粒为模板,扩增出了CMV启动子。

图2 SVA全基因组与poly(A)+HDVr、CMV片段PCR扩增结果


2.3同源重组及菌落PCR鉴定


将pWSK-29质粒经SacI/HindIII双酶切线性化,在同源重组酶ExnaseMulitS催化下,将CMV启动子、SVA全基因组、polyA+HDVr依次重组进pWSK-29载体,构建出pWSK-29-SVA重组质粒。将重组质粒pWSK-29-SVA转化至感受态细胞,过夜培养后,利用鉴定引物对菌落进行PCR鉴定并测序。经鉴定,所构建的SVA感染性克隆质粒完全符合预期设计(图3)。

图3 pWSK-29-SVA菌落PCR鉴定结果



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