1.2.316SrRNA基因序列克隆与分析。


以1∶100的比例,将“1.2.2”中分离纯化的菌液接种于400μLLB液体培养基,于37℃振荡培养6h,通过细菌全基因组DNA提取试剂盒提取细菌DNA后对其16SrRNA进行基因克隆、测序与分析,对细菌进行鉴定,引物分别为:27F(AGAGTTTGATCCTGGCTCAG)和1492R(GGTTACCTTGTTACGACTT)。PCR体系为20μL:1μL模板、1μL上游引物、1μL下游引物、7μLddH2O、10μL2×SanTaqPCRMix预混液,35个循环。通过1%琼脂糖凝胶电泳检测PCR产物并于紫外光下确认产物大小符合预期,寄送至生工生物工程(广州)股份有限公司进行双向测序,并对测序结果进行分析。


1.2.4生化鉴定。


无菌条件下,取100μLS1菌液在TSA平板上划线涂板,于28"℃下培养12h,取单菌落接种在微量生化反应管中,将微量生化反应管放置28℃培养18~24h,根据杭州滨和微生物试剂有限公司《细菌微量生化反应管说明书》确认S1细菌生化反应结果。通过《伯杰细菌鉴定手册》《常见细菌鉴定手册》对S1生化特性进行鉴定。


1.2.5药敏试验。


在无菌条件下制备10个TSA平板,每个平板均匀涂布100μL菌液,等距平贴3张药敏纸片。以3个不同角度测量每个抑菌环直径,最后取3次测量的平均值,长度单位mm,记录在册,整理并以《NCCLS药敏试验标准》和杭州滨和微生物试剂有限公司《抗生素类药敏纸片使用说明书》为标准判断药敏试验结果。


1.2.6细菌生长曲线绘制。


在无菌条件下接种哈维氏弧菌至装有5 mL TSB培养基的试管中,于28℃培养12 h;再以1∶100比例接种菌液于装有100 mL TSB培养基的锥形瓶,于28℃培养;选择不同时间点(0、0.5、1.5、2.5、3.0、5.0、6.5、8.0、12.0、16.0、20.0和24.0 h),收集菌液,在无菌条件不同稀释倍数下(×105、×107、×109和×1011倍)涂布在TSA平板上,于28℃培养箱中培养12 h后计数,有效计数范围为10~200。同时通过分光光度计在波长600 nm条件下测量该时间点的OD 600值,菌液浓度较高时,将菌液稀释至OD600值在0.4~0.6区间再进行测量,测量结果乘稀释倍数,记录在册。


2结果与分析


2.1鱼病诊断结果


对Ec1、Ec2、Ec33条患病斜带石斑鱼进行目检,发现其均体表变黑,严重溃烂并出现不规则的白色隆起疥疮。Ec1背鳍相对完好,尾鳍开始溃烂,胸部和尾部有充血。Ec2头部和胸部有白色疥疮,尾鳍有溃烂,嘴部充血。Ec3体表出现大量不规则白色疥疮,还出现了淡黄色结节,尾鳍和背鳍完全溃烂。

对Ec1、Ec2、Ec33条患病斜带石斑鱼进行剖检,发现其体内肝脏充血(图1~3)。Ec1肝脏充血肿大,脾脏糜烂消解不见,肠道内部呈黄色,有积水和胀气。Ec2鳃部糜烂呈灰色,肝脏充血,脾脏充血呈熔解态,肠道内部呈黄色。Ec3鳃部糜烂,肝脏充血,脾脏充血,肠道发红,有胀气。


根据目检结果和剖检结果,初步判断,患病斜带石斑鱼是受到细菌感染所致。


2.2细菌分离纯化


对Ec1、Ec2、Ec3体表病灶(Sk)、肝脏(Li)、脾脏(Sp)3个出现病理变化的部位在TSA平板、LB平板、TCSB平板划线接种。其中,LB平板上菌落数量相较TSA平板和TCBS平板上菌落数量明显减少,证明分离出的细菌更需要高营养培养基。TSA培养基对细菌没有筛选作用,且营养丰富,菌落生长数量最高,但形态并无较大差异。划线培养后TCBS琼脂培养基对细菌具有筛选作用,Ec1、Ec2、Ec3体表病灶(Sk)、肝脏(Li)、脾脏(Sp)3个出现病理变化的部位划线接种于TCBS平板上培养后均出现黄色且大小、形态一致的菌落。

挑选其中优势菌落,单菌落接种于400μLLB液体培养基(表1),37℃振荡培养12h后在菌液中添加等体积浓度为40%的灭菌甘油,于-80℃保存。


2.316SrRNA序列分析


将测序结果进行拼接通过Blast进行分析,并通过MEGA7.0进行多序列比对和同源建树,以Neighbor-Joining法构建系统发育进化树。分析显示,S116SrRNA基因序列为1191bp,Blast结果显示该菌株同哈维氏弧菌其他菌株差异较大,与2018年被报道的V.harveyihq-V149聚为一支(图4)。

2.4细菌生化特性

哈维氏弧菌S1的生理生化反应结果显示(表2),阿拉伯糖、鸟氨酸脱羧酶葡萄糖、赖氨酸脱羧酶、精氨酸脱羧酶、甘露醇、蕈糖等反应为阳性,蛋白胨水、精氨酸双水解酶、核糖、肌醇、硫化氢等反应为阴性。同《伯杰细菌鉴定手册》《常见细菌鉴定手册》上哈维氏弧菌的生化特征吻合。


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